Protein–RNA interactions for Protein: P55041

Gem, GTP-binding protein GEM, mousemouse

Predictions only

Length 295 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GemP55041 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GemP55041 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GemP55041 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GemP55041 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GemP55041 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GemP55041 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GemP55041 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GemP55041 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GemP55041 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GemP55041 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
GemP55041 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GemP55041 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GemP55041 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GemP55041 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GemP55041 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
GemP55041 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GemP55041 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GemP55041 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GemP55041 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GemP55041 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GemP55041 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GemP55041 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GemP55041 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GemP55041 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GemP55041 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GemP55041 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GemP55041 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GemP55041 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GemP55041 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GemP55041 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GemP55041 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GemP55041 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GemP55041 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GemP55041 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GemP55041 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GemP55041 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GemP55041 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GemP55041 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GemP55041 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
GemP55041 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GemP55041 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
GemP55041 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
GemP55041 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
GemP55041 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GemP55041 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
GemP55041 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GemP55041 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GemP55041 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GemP55041 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GemP55041 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GemP55041 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GemP55041 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
GemP55041 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GemP55041 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GemP55041 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GemP55041 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GemP55041 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
GemP55041 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GemP55041 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GemP55041 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GemP55041 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GemP55041 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GemP55041 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GemP55041 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GemP55041 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GemP55041 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GemP55041 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
GemP55041 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GemP55041 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GemP55041 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GemP55041 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
GemP55041 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GemP55041 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GemP55041 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GemP55041 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
GemP55041 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GemP55041 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GemP55041 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
GemP55041 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GemP55041 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
GemP55041 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
GemP55041 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GemP55041 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GemP55041 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GemP55041 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GemP55041 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GemP55041 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GemP55041 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GemP55041 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GemP55041 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GemP55041 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GemP55041 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GemP55041 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GemP55041 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GemP55041 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GemP55041 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GemP55041 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GemP55041 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GemP55041 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GemP55041 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.1 ms