Protein–RNA interactions for Protein: P53996

Cnbp, Cellular nucleic acid-binding protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CnbpP53996 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
CnbpP53996 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
CnbpP53996 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
CnbpP53996 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
CnbpP53996 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
CnbpP53996 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
CnbpP53996 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
CnbpP53996 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
CnbpP53996 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
CnbpP53996 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
CnbpP53996 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
CnbpP53996 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
CnbpP53996 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
CnbpP53996 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
CnbpP53996 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
CnbpP53996 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
CnbpP53996 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
CnbpP53996 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
CnbpP53996 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
CnbpP53996 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
CnbpP53996 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
CnbpP53996 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
CnbpP53996 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
CnbpP53996 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
CnbpP53996 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
CnbpP53996 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
CnbpP53996 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
CnbpP53996 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
CnbpP53996 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
CnbpP53996 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
CnbpP53996 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
CnbpP53996 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
CnbpP53996 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
CnbpP53996 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
CnbpP53996 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
CnbpP53996 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
CnbpP53996 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
CnbpP53996 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
CnbpP53996 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
CnbpP53996 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
CnbpP53996 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
CnbpP53996 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
CnbpP53996 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
CnbpP53996 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
CnbpP53996 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
CnbpP53996 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
CnbpP53996 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
CnbpP53996 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
CnbpP53996 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
CnbpP53996 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
CnbpP53996 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
CnbpP53996 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
CnbpP53996 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
CnbpP53996 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
CnbpP53996 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
CnbpP53996 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
CnbpP53996 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
CnbpP53996 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
CnbpP53996 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
CnbpP53996 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
CnbpP53996 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
CnbpP53996 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
CnbpP53996 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
CnbpP53996 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
CnbpP53996 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
CnbpP53996 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
CnbpP53996 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
CnbpP53996 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
CnbpP53996 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
CnbpP53996 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
CnbpP53996 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
CnbpP53996 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
CnbpP53996 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
CnbpP53996 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
CnbpP53996 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
CnbpP53996 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
CnbpP53996 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
CnbpP53996 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
CnbpP53996 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
CnbpP53996 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
CnbpP53996 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
CnbpP53996 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
CnbpP53996 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
CnbpP53996 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
CnbpP53996 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
CnbpP53996 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
CnbpP53996 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
CnbpP53996 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
CnbpP53996 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
CnbpP53996 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
CnbpP53996 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
CnbpP53996 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
CnbpP53996 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
CnbpP53996 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
CnbpP53996 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
CnbpP53996 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
CnbpP53996 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
CnbpP53996 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
CnbpP53996 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
CnbpP53996 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms