Protein–RNA interactions for Protein: P52483

Ube2e3, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 E3, mousemouse

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2e3P52483 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ube2e3P52483 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ube2e3P52483 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ube2e3P52483 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ube2e3P52483 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ube2e3P52483 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ube2e3P52483 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ube2e3P52483 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ube2e3P52483 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ube2e3P52483 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ube2e3P52483 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ube2e3P52483 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ube2e3P52483 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Ube2e3P52483 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ube2e3P52483 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ube2e3P52483 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ube2e3P52483 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ube2e3P52483 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ube2e3P52483 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ube2e3P52483 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ube2e3P52483 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ube2e3P52483 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ube2e3P52483 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ube2e3P52483 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ube2e3P52483 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ube2e3P52483 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ube2e3P52483 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ube2e3P52483 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ube2e3P52483 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Ube2e3P52483 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ube2e3P52483 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ube2e3P52483 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ube2e3P52483 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ube2e3P52483 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ube2e3P52483 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ube2e3P52483 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ube2e3P52483 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ube2e3P52483 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ube2e3P52483 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ube2e3P52483 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ube2e3P52483 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ube2e3P52483 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ube2e3P52483 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ube2e3P52483 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ube2e3P52483 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ube2e3P52483 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ube2e3P52483 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ube2e3P52483 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ube2e3P52483 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ube2e3P52483 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ube2e3P52483 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ube2e3P52483 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ube2e3P52483 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ube2e3P52483 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ube2e3P52483 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ube2e3P52483 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ube2e3P52483 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ube2e3P52483 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ube2e3P52483 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ube2e3P52483 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ube2e3P52483 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ube2e3P52483 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ube2e3P52483 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Ube2e3P52483 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ube2e3P52483 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ube2e3P52483 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ube2e3P52483 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ube2e3P52483 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ube2e3P52483 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ube2e3P52483 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ube2e3P52483 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ube2e3P52483 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ube2e3P52483 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ube2e3P52483 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ube2e3P52483 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ube2e3P52483 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ube2e3P52483 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ube2e3P52483 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ube2e3P52483 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ube2e3P52483 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ube2e3P52483 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ube2e3P52483 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ube2e3P52483 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ube2e3P52483 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ube2e3P52483 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ube2e3P52483 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ube2e3P52483 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Ube2e3P52483 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ube2e3P52483 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Ube2e3P52483 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Ube2e3P52483 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ube2e3P52483 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ube2e3P52483 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ube2e3P52483 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ube2e3P52483 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ube2e3P52483 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Ube2e3P52483 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ube2e3P52483 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Ube2e3P52483 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ube2e3P52483 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms