Protein–RNA interactions for Protein: P50637

Tspo, Translocator protein, mousemouse

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TspoP50637 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
TspoP50637 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
TspoP50637 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
TspoP50637 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
TspoP50637 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
TspoP50637 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
TspoP50637 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
TspoP50637 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
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TspoP50637 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
TspoP50637 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
TspoP50637 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
TspoP50637 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
TspoP50637 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
TspoP50637 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
TspoP50637 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
TspoP50637 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
TspoP50637 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
TspoP50637 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
TspoP50637 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
TspoP50637 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
TspoP50637 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
TspoP50637 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
TspoP50637 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
TspoP50637 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
TspoP50637 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
TspoP50637 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
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TspoP50637 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
TspoP50637 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
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TspoP50637 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
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TspoP50637 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
TspoP50637 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
TspoP50637 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
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TspoP50637 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
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TspoP50637 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
TspoP50637 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
TspoP50637 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
TspoP50637 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
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TspoP50637 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
TspoP50637 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
TspoP50637 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
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TspoP50637 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
TspoP50637 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.35
TspoP50637 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
TspoP50637 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
TspoP50637 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
TspoP50637 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
TspoP50637 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
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TspoP50637 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
TspoP50637 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
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TspoP50637 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
TspoP50637 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
TspoP50637 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
TspoP50637 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
TspoP50637 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
TspoP50637 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
TspoP50637 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
TspoP50637 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
TspoP50637 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
TspoP50637 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
TspoP50637 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
TspoP50637 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
TspoP50637 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
TspoP50637 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
TspoP50637 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
TspoP50637 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
TspoP50637 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
TspoP50637 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
TspoP50637 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
TspoP50637 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
TspoP50637 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
TspoP50637 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
TspoP50637 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
TspoP50637 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
TspoP50637 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms