Protein–RNA interactions for Protein: P50481

Lhx3, LIM/homeobox protein Lhx3, mousemouse

Predictions only

Length 400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lhx3P50481 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lhx3P50481 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lhx3P50481 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lhx3P50481 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lhx3P50481 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lhx3P50481 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lhx3P50481 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lhx3P50481 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lhx3P50481 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lhx3P50481 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lhx3P50481 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lhx3P50481 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lhx3P50481 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lhx3P50481 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lhx3P50481 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lhx3P50481 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lhx3P50481 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lhx3P50481 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lhx3P50481 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lhx3P50481 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lhx3P50481 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lhx3P50481 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lhx3P50481 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lhx3P50481 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lhx3P50481 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lhx3P50481 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lhx3P50481 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Lhx3P50481 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Lhx3P50481 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lhx3P50481 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lhx3P50481 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lhx3P50481 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lhx3P50481 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lhx3P50481 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lhx3P50481 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lhx3P50481 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lhx3P50481 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lhx3P50481 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lhx3P50481 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lhx3P50481 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lhx3P50481 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lhx3P50481 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lhx3P50481 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lhx3P50481 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lhx3P50481 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lhx3P50481 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lhx3P50481 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lhx3P50481 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lhx3P50481 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lhx3P50481 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lhx3P50481 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lhx3P50481 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lhx3P50481 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lhx3P50481 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Lhx3P50481 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lhx3P50481 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Lhx3P50481 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lhx3P50481 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lhx3P50481 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lhx3P50481 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lhx3P50481 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lhx3P50481 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lhx3P50481 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lhx3P50481 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lhx3P50481 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lhx3P50481 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lhx3P50481 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lhx3P50481 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lhx3P50481 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lhx3P50481 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lhx3P50481 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lhx3P50481 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lhx3P50481 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lhx3P50481 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lhx3P50481 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lhx3P50481 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lhx3P50481 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lhx3P50481 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lhx3P50481 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lhx3P50481 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lhx3P50481 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lhx3P50481 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lhx3P50481 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lhx3P50481 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lhx3P50481 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lhx3P50481 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lhx3P50481 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Lhx3P50481 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lhx3P50481 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lhx3P50481 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lhx3P50481 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lhx3P50481 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lhx3P50481 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lhx3P50481 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lhx3P50481 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lhx3P50481 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lhx3P50481 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lhx3P50481 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lhx3P50481 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lhx3P50481 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms