Protein–RNA interactions for Protein: P50404

Sftpd, Pulmonary surfactant-associated protein D, mousemouse

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SftpdP50404 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SftpdP50404 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SftpdP50404 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SftpdP50404 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SftpdP50404 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SftpdP50404 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SftpdP50404 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SftpdP50404 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SftpdP50404 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SftpdP50404 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SftpdP50404 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SftpdP50404 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SftpdP50404 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SftpdP50404 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SftpdP50404 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SftpdP50404 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SftpdP50404 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SftpdP50404 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SftpdP50404 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SftpdP50404 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SftpdP50404 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SftpdP50404 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SftpdP50404 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SftpdP50404 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SftpdP50404 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SftpdP50404 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SftpdP50404 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SftpdP50404 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SftpdP50404 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SftpdP50404 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SftpdP50404 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SftpdP50404 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SftpdP50404 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SftpdP50404 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SftpdP50404 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SftpdP50404 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SftpdP50404 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SftpdP50404 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SftpdP50404 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SftpdP50404 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SftpdP50404 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SftpdP50404 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SftpdP50404 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SftpdP50404 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SftpdP50404 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SftpdP50404 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SftpdP50404 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SftpdP50404 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SftpdP50404 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SftpdP50404 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SftpdP50404 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SftpdP50404 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SftpdP50404 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SftpdP50404 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SftpdP50404 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SftpdP50404 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SftpdP50404 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SftpdP50404 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SftpdP50404 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SftpdP50404 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SftpdP50404 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SftpdP50404 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SftpdP50404 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SftpdP50404 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SftpdP50404 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SftpdP50404 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SftpdP50404 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SftpdP50404 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SftpdP50404 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SftpdP50404 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SftpdP50404 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SftpdP50404 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SftpdP50404 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SftpdP50404 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SftpdP50404 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SftpdP50404 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SftpdP50404 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SftpdP50404 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SftpdP50404 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SftpdP50404 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SftpdP50404 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SftpdP50404 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SftpdP50404 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SftpdP50404 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SftpdP50404 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SftpdP50404 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SftpdP50404 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SftpdP50404 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SftpdP50404 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SftpdP50404 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SftpdP50404 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SftpdP50404 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SftpdP50404 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SftpdP50404 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
SftpdP50404 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SftpdP50404 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SftpdP50404 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SftpdP50404 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SftpdP50404 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SftpdP50404 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83.7 ms