Protein–RNA interactions for Protein: P50284

Ltbr, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 3, mousemouse

Predictions only

Length 415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LtbrP50284 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LtbrP50284 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LtbrP50284 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
LtbrP50284 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LtbrP50284 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
LtbrP50284 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LtbrP50284 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LtbrP50284 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
LtbrP50284 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LtbrP50284 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LtbrP50284 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LtbrP50284 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LtbrP50284 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
LtbrP50284 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
LtbrP50284 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
LtbrP50284 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
LtbrP50284 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
LtbrP50284 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
LtbrP50284 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
LtbrP50284 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LtbrP50284 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
LtbrP50284 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LtbrP50284 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LtbrP50284 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
LtbrP50284 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LtbrP50284 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
LtbrP50284 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
LtbrP50284 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LtbrP50284 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LtbrP50284 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LtbrP50284 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
LtbrP50284 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
LtbrP50284 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LtbrP50284 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LtbrP50284 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LtbrP50284 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LtbrP50284 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LtbrP50284 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LtbrP50284 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LtbrP50284 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
LtbrP50284 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LtbrP50284 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LtbrP50284 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LtbrP50284 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LtbrP50284 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LtbrP50284 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LtbrP50284 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LtbrP50284 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LtbrP50284 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LtbrP50284 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LtbrP50284 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LtbrP50284 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LtbrP50284 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LtbrP50284 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LtbrP50284 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LtbrP50284 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
LtbrP50284 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LtbrP50284 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LtbrP50284 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
LtbrP50284 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
LtbrP50284 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
LtbrP50284 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
LtbrP50284 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
LtbrP50284 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
LtbrP50284 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
LtbrP50284 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LtbrP50284 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LtbrP50284 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
LtbrP50284 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LtbrP50284 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
LtbrP50284 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
LtbrP50284 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LtbrP50284 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LtbrP50284 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LtbrP50284 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LtbrP50284 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LtbrP50284 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LtbrP50284 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
LtbrP50284 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LtbrP50284 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LtbrP50284 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LtbrP50284 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
LtbrP50284 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LtbrP50284 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LtbrP50284 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LtbrP50284 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LtbrP50284 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LtbrP50284 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
LtbrP50284 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
LtbrP50284 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LtbrP50284 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LtbrP50284 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
LtbrP50284 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LtbrP50284 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LtbrP50284 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
LtbrP50284 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LtbrP50284 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
LtbrP50284 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
LtbrP50284 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
LtbrP50284 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.9 ms