Protein–RNA interactions for Protein: P49813

Tmod1, Tropomodulin-1, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmod1P49813 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tmod1P49813 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tmod1P49813 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tmod1P49813 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tmod1P49813 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Tmod1P49813 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tmod1P49813 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tmod1P49813 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tmod1P49813 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tmod1P49813 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tmod1P49813 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tmod1P49813 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tmod1P49813 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tmod1P49813 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tmod1P49813 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tmod1P49813 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Tmod1P49813 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tmod1P49813 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tmod1P49813 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tmod1P49813 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tmod1P49813 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tmod1P49813 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tmod1P49813 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tmod1P49813 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tmod1P49813 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tmod1P49813 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tmod1P49813 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tmod1P49813 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tmod1P49813 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tmod1P49813 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Tmod1P49813 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tmod1P49813 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tmod1P49813 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tmod1P49813 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tmod1P49813 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tmod1P49813 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Tmod1P49813 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Tmod1P49813 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tmod1P49813 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tmod1P49813 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tmod1P49813 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Tmod1P49813 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tmod1P49813 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tmod1P49813 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tmod1P49813 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tmod1P49813 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Tmod1P49813 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tmod1P49813 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tmod1P49813 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tmod1P49813 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tmod1P49813 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tmod1P49813 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tmod1P49813 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tmod1P49813 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tmod1P49813 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tmod1P49813 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tmod1P49813 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tmod1P49813 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tmod1P49813 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tmod1P49813 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tmod1P49813 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Tmod1P49813 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tmod1P49813 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tmod1P49813 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tmod1P49813 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tmod1P49813 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tmod1P49813 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tmod1P49813 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tmod1P49813 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tmod1P49813 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Tmod1P49813 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tmod1P49813 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tmod1P49813 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tmod1P49813 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tmod1P49813 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tmod1P49813 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tmod1P49813 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tmod1P49813 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tmod1P49813 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tmod1P49813 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tmod1P49813 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tmod1P49813 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tmod1P49813 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tmod1P49813 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tmod1P49813 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tmod1P49813 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tmod1P49813 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tmod1P49813 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tmod1P49813 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tmod1P49813 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tmod1P49813 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tmod1P49813 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tmod1P49813 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tmod1P49813 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tmod1P49813 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tmod1P49813 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tmod1P49813 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Tmod1P49813 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tmod1P49813 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tmod1P49813 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.5 ms