Protein–RNA interactions for Protein: P49429

Hpd, 4-hydroxyphenylpyruvate dioxygenase, mousemouse

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HpdP49429 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HpdP49429 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HpdP49429 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HpdP49429 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HpdP49429 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HpdP49429 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HpdP49429 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HpdP49429 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HpdP49429 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HpdP49429 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HpdP49429 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HpdP49429 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HpdP49429 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HpdP49429 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HpdP49429 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HpdP49429 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HpdP49429 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HpdP49429 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HpdP49429 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HpdP49429 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HpdP49429 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HpdP49429 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HpdP49429 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HpdP49429 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HpdP49429 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HpdP49429 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
HpdP49429 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HpdP49429 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
HpdP49429 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HpdP49429 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HpdP49429 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HpdP49429 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HpdP49429 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HpdP49429 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HpdP49429 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HpdP49429 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HpdP49429 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HpdP49429 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HpdP49429 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HpdP49429 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HpdP49429 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HpdP49429 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HpdP49429 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HpdP49429 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HpdP49429 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HpdP49429 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HpdP49429 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HpdP49429 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HpdP49429 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HpdP49429 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HpdP49429 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HpdP49429 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HpdP49429 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HpdP49429 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HpdP49429 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HpdP49429 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
HpdP49429 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HpdP49429 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HpdP49429 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HpdP49429 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HpdP49429 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HpdP49429 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HpdP49429 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HpdP49429 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HpdP49429 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HpdP49429 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HpdP49429 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HpdP49429 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HpdP49429 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HpdP49429 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HpdP49429 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HpdP49429 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HpdP49429 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HpdP49429 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HpdP49429 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HpdP49429 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HpdP49429 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
HpdP49429 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HpdP49429 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
HpdP49429 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HpdP49429 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
HpdP49429 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
HpdP49429 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
HpdP49429 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HpdP49429 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HpdP49429 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
HpdP49429 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HpdP49429 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HpdP49429 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HpdP49429 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HpdP49429 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HpdP49429 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HpdP49429 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HpdP49429 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HpdP49429 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HpdP49429 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
HpdP49429 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
HpdP49429 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
HpdP49429 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
HpdP49429 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms