Protein–RNA interactions for Protein: P49222

Epb42, Erythrocyte membrane protein band 4.2, mousemouse

Predictions only

Length 691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Epb42P49222 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Epb42P49222 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Epb42P49222 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Epb42P49222 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Epb42P49222 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Epb42P49222 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Epb42P49222 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Epb42P49222 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Epb42P49222 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Epb42P49222 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Epb42P49222 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Epb42P49222 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Epb42P49222 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Epb42P49222 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Epb42P49222 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Epb42P49222 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Epb42P49222 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Epb42P49222 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Epb42P49222 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Epb42P49222 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Epb42P49222 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Epb42P49222 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Epb42P49222 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Epb42P49222 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Epb42P49222 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Epb42P49222 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Epb42P49222 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Epb42P49222 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Epb42P49222 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Epb42P49222 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Epb42P49222 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Epb42P49222 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Epb42P49222 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Epb42P49222 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Epb42P49222 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Epb42P49222 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Epb42P49222 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Epb42P49222 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Epb42P49222 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Epb42P49222 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Epb42P49222 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Epb42P49222 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Epb42P49222 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Epb42P49222 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Epb42P49222 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Epb42P49222 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Epb42P49222 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Epb42P49222 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Epb42P49222 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Epb42P49222 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Epb42P49222 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Epb42P49222 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Epb42P49222 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Epb42P49222 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Epb42P49222 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Epb42P49222 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Epb42P49222 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Epb42P49222 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Epb42P49222 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Epb42P49222 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Epb42P49222 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Epb42P49222 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Epb42P49222 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Epb42P49222 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Epb42P49222 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Epb42P49222 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Epb42P49222 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Epb42P49222 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Epb42P49222 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Epb42P49222 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Epb42P49222 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Epb42P49222 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Epb42P49222 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Epb42P49222 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Epb42P49222 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Epb42P49222 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Epb42P49222 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Epb42P49222 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Epb42P49222 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Epb42P49222 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Epb42P49222 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Epb42P49222 Gm20865-201ENSMUST00000179095 856 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Epb42P49222 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Epb42P49222 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Epb42P49222 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Epb42P49222 Gm38116-201ENSMUST00000193873 1533 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Epb42P49222 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Epb42P49222 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Epb42P49222 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Epb42P49222 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Epb42P49222 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Epb42P49222 Clec4d-201ENSMUST00000032240 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Epb42P49222 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Epb42P49222 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Epb42P49222 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Epb42P49222 Klk1b7-ps-201ENSMUST00000078897 448 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Epb42P49222 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Epb42P49222 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Epb42P49222 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Epb42P49222 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms