Protein–RNA interactions for Protein: P47963

Rpl13, 60S ribosomal protein L13, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl13P47963 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rpl13P47963 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Rpl13P47963 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rpl13P47963 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rpl13P47963 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rpl13P47963 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rpl13P47963 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rpl13P47963 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rpl13P47963 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rpl13P47963 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rpl13P47963 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rpl13P47963 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Rpl13P47963 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rpl13P47963 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rpl13P47963 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rpl13P47963 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rpl13P47963 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rpl13P47963 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rpl13P47963 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rpl13P47963 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rpl13P47963 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rpl13P47963 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rpl13P47963 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rpl13P47963 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rpl13P47963 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rpl13P47963 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rpl13P47963 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rpl13P47963 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rpl13P47963 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rpl13P47963 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rpl13P47963 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rpl13P47963 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rpl13P47963 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rpl13P47963 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Rpl13P47963 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rpl13P47963 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Rpl13P47963 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rpl13P47963 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rpl13P47963 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rpl13P47963 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rpl13P47963 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rpl13P47963 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rpl13P47963 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rpl13P47963 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rpl13P47963 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rpl13P47963 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rpl13P47963 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rpl13P47963 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rpl13P47963 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rpl13P47963 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rpl13P47963 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rpl13P47963 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Rpl13P47963 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rpl13P47963 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rpl13P47963 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Rpl13P47963 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rpl13P47963 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rpl13P47963 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rpl13P47963 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rpl13P47963 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rpl13P47963 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rpl13P47963 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rpl13P47963 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rpl13P47963 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rpl13P47963 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rpl13P47963 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rpl13P47963 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rpl13P47963 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rpl13P47963 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rpl13P47963 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rpl13P47963 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rpl13P47963 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rpl13P47963 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rpl13P47963 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rpl13P47963 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rpl13P47963 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rpl13P47963 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Rpl13P47963 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rpl13P47963 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Rpl13P47963 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rpl13P47963 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rpl13P47963 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rpl13P47963 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rpl13P47963 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rpl13P47963 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rpl13P47963 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rpl13P47963 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rpl13P47963 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rpl13P47963 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rpl13P47963 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rpl13P47963 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rpl13P47963 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rpl13P47963 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rpl13P47963 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rpl13P47963 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rpl13P47963 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rpl13P47963 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rpl13P47963 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Rpl13P47963 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rpl13P47963 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms