Protein–RNA interactions for Protein: P47867

Scg3, Secretogranin-3, mousemouse

Predictions only

Length 471 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scg3P47867 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Scg3P47867 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Scg3P47867 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Scg3P47867 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Scg3P47867 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Scg3P47867 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Scg3P47867 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Scg3P47867 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Scg3P47867 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Scg3P47867 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Scg3P47867 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Scg3P47867 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Scg3P47867 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Scg3P47867 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Scg3P47867 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Scg3P47867 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Scg3P47867 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Scg3P47867 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Scg3P47867 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Scg3P47867 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Scg3P47867 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Scg3P47867 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Scg3P47867 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scg3P47867 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scg3P47867 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Scg3P47867 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scg3P47867 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scg3P47867 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scg3P47867 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scg3P47867 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scg3P47867 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scg3P47867 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Scg3P47867 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scg3P47867 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scg3P47867 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scg3P47867 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scg3P47867 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Scg3P47867 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scg3P47867 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scg3P47867 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scg3P47867 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scg3P47867 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scg3P47867 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scg3P47867 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scg3P47867 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scg3P47867 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scg3P47867 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scg3P47867 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scg3P47867 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scg3P47867 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scg3P47867 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scg3P47867 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scg3P47867 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scg3P47867 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scg3P47867 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scg3P47867 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scg3P47867 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scg3P47867 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scg3P47867 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Scg3P47867 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scg3P47867 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scg3P47867 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scg3P47867 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Scg3P47867 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scg3P47867 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scg3P47867 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scg3P47867 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scg3P47867 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Scg3P47867 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scg3P47867 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scg3P47867 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scg3P47867 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scg3P47867 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scg3P47867 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scg3P47867 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scg3P47867 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Scg3P47867 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scg3P47867 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Scg3P47867 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Scg3P47867 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Scg3P47867 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Scg3P47867 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Scg3P47867 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Scg3P47867 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Scg3P47867 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Scg3P47867 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Scg3P47867 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Scg3P47867 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Scg3P47867 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Scg3P47867 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Scg3P47867 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Scg3P47867 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Scg3P47867 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Scg3P47867 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Scg3P47867 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Scg3P47867 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Scg3P47867 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Scg3P47867 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Scg3P47867 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Scg3P47867 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.5 ms