Protein–RNA interactions for Protein: P47806

Gli1, Zinc finger protein GLI1, mousemouse

Predictions only

Length 1,111 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gli1P47806 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gli1P47806 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gli1P47806 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gli1P47806 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gli1P47806 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gli1P47806 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gli1P47806 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gli1P47806 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gli1P47806 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gli1P47806 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gli1P47806 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gli1P47806 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gli1P47806 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gli1P47806 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gli1P47806 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gli1P47806 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gli1P47806 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gli1P47806 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gli1P47806 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gli1P47806 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gli1P47806 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gli1P47806 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gli1P47806 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gli1P47806 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gli1P47806 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gli1P47806 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gli1P47806 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gli1P47806 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gli1P47806 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gli1P47806 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Gli1P47806 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gli1P47806 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gli1P47806 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gli1P47806 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gli1P47806 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gli1P47806 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gli1P47806 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gli1P47806 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gli1P47806 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gli1P47806 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gli1P47806 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gli1P47806 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gli1P47806 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gli1P47806 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gli1P47806 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gli1P47806 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gli1P47806 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gli1P47806 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gli1P47806 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gli1P47806 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gli1P47806 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gli1P47806 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gli1P47806 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Gli1P47806 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gli1P47806 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Gli1P47806 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gli1P47806 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gli1P47806 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gli1P47806 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Gli1P47806 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gli1P47806 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gli1P47806 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gli1P47806 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gli1P47806 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gli1P47806 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gli1P47806 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gli1P47806 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gli1P47806 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gli1P47806 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gli1P47806 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gli1P47806 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gli1P47806 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gli1P47806 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gli1P47806 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gli1P47806 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gli1P47806 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gli1P47806 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gli1P47806 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gli1P47806 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gli1P47806 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gli1P47806 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gli1P47806 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Gli1P47806 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gli1P47806 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gli1P47806 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gli1P47806 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gli1P47806 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gli1P47806 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gli1P47806 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Gli1P47806 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gli1P47806 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gli1P47806 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gli1P47806 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gli1P47806 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gli1P47806 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Gli1P47806 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gli1P47806 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gli1P47806 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gli1P47806 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gli1P47806 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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