Protein–RNA interactions for Protein: P46467

Vps4b, Vacuolar protein sorting-associated protein 4B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps4bP46467 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vps4bP46467 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vps4bP46467 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vps4bP46467 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vps4bP46467 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vps4bP46467 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vps4bP46467 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vps4bP46467 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vps4bP46467 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vps4bP46467 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vps4bP46467 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Vps4bP46467 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vps4bP46467 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vps4bP46467 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vps4bP46467 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vps4bP46467 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vps4bP46467 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vps4bP46467 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vps4bP46467 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vps4bP46467 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vps4bP46467 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vps4bP46467 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vps4bP46467 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vps4bP46467 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vps4bP46467 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vps4bP46467 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vps4bP46467 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vps4bP46467 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vps4bP46467 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vps4bP46467 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vps4bP46467 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vps4bP46467 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vps4bP46467 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vps4bP46467 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vps4bP46467 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vps4bP46467 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vps4bP46467 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vps4bP46467 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vps4bP46467 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vps4bP46467 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vps4bP46467 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vps4bP46467 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vps4bP46467 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vps4bP46467 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vps4bP46467 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vps4bP46467 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vps4bP46467 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vps4bP46467 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Vps4bP46467 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vps4bP46467 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vps4bP46467 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vps4bP46467 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vps4bP46467 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vps4bP46467 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vps4bP46467 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vps4bP46467 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vps4bP46467 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vps4bP46467 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vps4bP46467 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vps4bP46467 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vps4bP46467 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Vps4bP46467 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Vps4bP46467 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Vps4bP46467 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Vps4bP46467 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Vps4bP46467 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Vps4bP46467 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Vps4bP46467 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vps4bP46467 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vps4bP46467 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vps4bP46467 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vps4bP46467 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vps4bP46467 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vps4bP46467 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vps4bP46467 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vps4bP46467 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vps4bP46467 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Vps4bP46467 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vps4bP46467 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vps4bP46467 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vps4bP46467 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vps4bP46467 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vps4bP46467 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vps4bP46467 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vps4bP46467 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vps4bP46467 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vps4bP46467 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vps4bP46467 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vps4bP46467 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vps4bP46467 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vps4bP46467 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vps4bP46467 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vps4bP46467 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vps4bP46467 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vps4bP46467 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vps4bP46467 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vps4bP46467 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vps4bP46467 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vps4bP46467 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vps4bP46467 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms