Protein–RNA interactions for Protein: P46414

Cdkn1b, Cyclin-dependent kinase inhibitor 1B, mousemouse

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkn1bP46414 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cdkn1bP46414 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cdkn1bP46414 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cdkn1bP46414 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cdkn1bP46414 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cdkn1bP46414 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cdkn1bP46414 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Cdkn1bP46414 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cdkn1bP46414 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cdkn1bP46414 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cdkn1bP46414 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cdkn1bP46414 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cdkn1bP46414 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cdkn1bP46414 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cdkn1bP46414 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cdkn1bP46414 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cdkn1bP46414 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cdkn1bP46414 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cdkn1bP46414 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cdkn1bP46414 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cdkn1bP46414 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cdkn1bP46414 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cdkn1bP46414 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cdkn1bP46414 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cdkn1bP46414 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cdkn1bP46414 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cdkn1bP46414 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cdkn1bP46414 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cdkn1bP46414 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cdkn1bP46414 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cdkn1bP46414 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cdkn1bP46414 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cdkn1bP46414 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cdkn1bP46414 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cdkn1bP46414 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cdkn1bP46414 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cdkn1bP46414 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cdkn1bP46414 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Cdkn1bP46414 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cdkn1bP46414 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Cdkn1bP46414 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cdkn1bP46414 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cdkn1bP46414 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cdkn1bP46414 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cdkn1bP46414 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cdkn1bP46414 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cdkn1bP46414 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cdkn1bP46414 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cdkn1bP46414 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cdkn1bP46414 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cdkn1bP46414 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Cdkn1bP46414 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Cdkn1bP46414 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cdkn1bP46414 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cdkn1bP46414 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cdkn1bP46414 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cdkn1bP46414 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cdkn1bP46414 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cdkn1bP46414 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cdkn1bP46414 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cdkn1bP46414 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cdkn1bP46414 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cdkn1bP46414 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Cdkn1bP46414 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cdkn1bP46414 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cdkn1bP46414 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cdkn1bP46414 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cdkn1bP46414 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cdkn1bP46414 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cdkn1bP46414 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cdkn1bP46414 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cdkn1bP46414 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cdkn1bP46414 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cdkn1bP46414 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cdkn1bP46414 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Cdkn1bP46414 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cdkn1bP46414 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cdkn1bP46414 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cdkn1bP46414 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cdkn1bP46414 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cdkn1bP46414 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Cdkn1bP46414 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cdkn1bP46414 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cdkn1bP46414 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cdkn1bP46414 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cdkn1bP46414 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cdkn1bP46414 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cdkn1bP46414 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cdkn1bP46414 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cdkn1bP46414 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cdkn1bP46414 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cdkn1bP46414 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cdkn1bP46414 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cdkn1bP46414 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cdkn1bP46414 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cdkn1bP46414 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cdkn1bP46414 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cdkn1bP46414 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cdkn1bP46414 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cdkn1bP46414 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.1 ms