Protein–RNA interactions for Protein: P42337

Pik3ca, Phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit alpha isoform, mousemouse

Predictions only

Length 1,068 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pik3caP42337 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pik3caP42337 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pik3caP42337 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pik3caP42337 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pik3caP42337 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pik3caP42337 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pik3caP42337 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Pik3caP42337 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pik3caP42337 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pik3caP42337 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pik3caP42337 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pik3caP42337 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Pik3caP42337 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Pik3caP42337 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pik3caP42337 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pik3caP42337 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pik3caP42337 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pik3caP42337 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pik3caP42337 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pik3caP42337 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pik3caP42337 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pik3caP42337 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pik3caP42337 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pik3caP42337 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pik3caP42337 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pik3caP42337 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pik3caP42337 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Pik3caP42337 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pik3caP42337 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pik3caP42337 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pik3caP42337 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pik3caP42337 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pik3caP42337 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pik3caP42337 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pik3caP42337 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pik3caP42337 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pik3caP42337 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pik3caP42337 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pik3caP42337 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pik3caP42337 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pik3caP42337 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pik3caP42337 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Pik3caP42337 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Pik3caP42337 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Pik3caP42337 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pik3caP42337 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pik3caP42337 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pik3caP42337 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pik3caP42337 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pik3caP42337 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pik3caP42337 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pik3caP42337 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pik3caP42337 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pik3caP42337 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pik3caP42337 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pik3caP42337 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pik3caP42337 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pik3caP42337 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pik3caP42337 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pik3caP42337 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pik3caP42337 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pik3caP42337 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pik3caP42337 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pik3caP42337 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pik3caP42337 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pik3caP42337 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Pik3caP42337 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pik3caP42337 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pik3caP42337 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pik3caP42337 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Pik3caP42337 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pik3caP42337 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pik3caP42337 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pik3caP42337 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pik3caP42337 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pik3caP42337 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pik3caP42337 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pik3caP42337 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pik3caP42337 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pik3caP42337 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pik3caP42337 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Pik3caP42337 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Pik3caP42337 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pik3caP42337 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pik3caP42337 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pik3caP42337 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pik3caP42337 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pik3caP42337 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pik3caP42337 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pik3caP42337 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pik3caP42337 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pik3caP42337 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pik3caP42337 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pik3caP42337 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pik3caP42337 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pik3caP42337 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pik3caP42337 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pik3caP42337 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pik3caP42337 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pik3caP42337 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms