Protein–RNA interactions for Protein: P40240

Cd9, CD9 antigen, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd9P40240 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cd9P40240 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cd9P40240 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cd9P40240 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cd9P40240 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cd9P40240 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cd9P40240 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cd9P40240 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cd9P40240 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cd9P40240 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cd9P40240 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cd9P40240 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cd9P40240 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cd9P40240 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Cd9P40240 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cd9P40240 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Cd9P40240 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cd9P40240 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cd9P40240 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cd9P40240 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cd9P40240 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cd9P40240 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cd9P40240 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cd9P40240 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cd9P40240 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cd9P40240 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cd9P40240 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cd9P40240 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cd9P40240 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cd9P40240 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cd9P40240 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cd9P40240 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cd9P40240 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cd9P40240 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cd9P40240 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cd9P40240 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cd9P40240 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cd9P40240 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cd9P40240 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cd9P40240 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Cd9P40240 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Cd9P40240 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Cd9P40240 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cd9P40240 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Cd9P40240 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cd9P40240 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cd9P40240 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cd9P40240 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cd9P40240 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Cd9P40240 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Cd9P40240 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cd9P40240 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cd9P40240 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cd9P40240 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cd9P40240 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC15□□□□□ -0.01
Cd9P40240 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cd9P40240 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cd9P40240 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cd9P40240 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Cd9P40240 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cd9P40240 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Cd9P40240 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cd9P40240 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cd9P40240 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cd9P40240 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cd9P40240 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cd9P40240 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cd9P40240 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cd9P40240 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cd9P40240 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cd9P40240 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cd9P40240 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Cd9P40240 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cd9P40240 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Cd9P40240 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cd9P40240 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Cd9P40240 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Cd9P40240 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cd9P40240 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cd9P40240 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cd9P40240 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Cd9P40240 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Cd9P40240 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cd9P40240 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cd9P40240 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cd9P40240 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cd9P40240 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cd9P40240 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cd9P40240 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cd9P40240 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cd9P40240 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cd9P40240 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cd9P40240 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cd9P40240 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cd9P40240 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cd9P40240 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cd9P40240 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cd9P40240 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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