Protein–RNA interactions for Protein: P40201

Chd1, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,711 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chd1P40201 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Chd1P40201 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Chd1P40201 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Chd1P40201 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Chd1P40201 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Chd1P40201 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Chd1P40201 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Chd1P40201 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Chd1P40201 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Chd1P40201 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Chd1P40201 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Chd1P40201 E130006D01Rik-203ENSMUST00000137398 906 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Chd1P40201 Gm44974-201ENSMUST00000206387 1279 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Chd1P40201 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Chd1P40201 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Chd1P40201 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Chd1P40201 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Chd1P40201 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Chd1P40201 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Chd1P40201 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Chd1P40201 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Chd1P40201 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Chd1P40201 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Chd1P40201 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Chd1P40201 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Chd1P40201 Gm13562-201ENSMUST00000125198 797 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Chd1P40201 Gm15635-202ENSMUST00000131160 917 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Chd1P40201 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Chd1P40201 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Chd1P40201 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Chd1P40201 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Chd1P40201 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Chd1P40201 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Chd1P40201 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Chd1P40201 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Chd1P40201 Gm39318-201ENSMUST00000214606 1118 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Chd1P40201 AC159747.1-201ENSMUST00000219903 265 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Chd1P40201 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Chd1P40201 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Chd1P40201 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Chd1P40201 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Chd1P40201 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Chd1P40201 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Chd1P40201 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Chd1P40201 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Chd1P40201 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Chd1P40201 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Chd1P40201 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Chd1P40201 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Chd1P40201 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Chd1P40201 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Chd1P40201 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Chd1P40201 Hspb9-201ENSMUST00000017976 652 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Chd1P40201 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Chd1P40201 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Chd1P40201 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Chd1P40201 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Chd1P40201 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Chd1P40201 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Chd1P40201 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Chd1P40201 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Chd1P40201 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Chd1P40201 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Chd1P40201 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Chd1P40201 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Chd1P40201 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Chd1P40201 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Chd1P40201 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Chd1P40201 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Chd1P40201 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Chd1P40201 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Chd1P40201 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Chd1P40201 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Chd1P40201 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Chd1P40201 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Chd1P40201 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Chd1P40201 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Chd1P40201 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Chd1P40201 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Chd1P40201 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Chd1P40201 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Chd1P40201 Gm18054-201ENSMUST00000207539 555 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Chd1P40201 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Chd1P40201 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Chd1P40201 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Chd1P40201 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Chd1P40201 AC153845.2-201ENSMUST00000217535 673 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Chd1P40201 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Chd1P40201 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Chd1P40201 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Chd1P40201 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Chd1P40201 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Chd1P40201 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Chd1P40201 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Chd1P40201 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Chd1P40201 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Chd1P40201 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Chd1P40201 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Chd1P40201 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Chd1P40201 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms