Protein–RNA interactions for Protein: P35821

Ptpn1, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 1, mousemouse

Predictions only

Length 432 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn1P35821 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ptpn1P35821 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ptpn1P35821 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ptpn1P35821 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ptpn1P35821 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ptpn1P35821 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ptpn1P35821 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ptpn1P35821 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ptpn1P35821 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ptpn1P35821 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ptpn1P35821 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ptpn1P35821 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ptpn1P35821 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ptpn1P35821 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ptpn1P35821 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ptpn1P35821 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ptpn1P35821 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ptpn1P35821 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ptpn1P35821 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ptpn1P35821 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ptpn1P35821 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ptpn1P35821 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ptpn1P35821 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ptpn1P35821 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ptpn1P35821 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Ptpn1P35821 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Ptpn1P35821 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Ptpn1P35821 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Ptpn1P35821 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ptpn1P35821 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ptpn1P35821 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ptpn1P35821 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ptpn1P35821 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ptpn1P35821 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ptpn1P35821 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ptpn1P35821 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ptpn1P35821 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ptpn1P35821 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ptpn1P35821 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ptpn1P35821 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ptpn1P35821 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ptpn1P35821 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ptpn1P35821 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ptpn1P35821 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ptpn1P35821 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ptpn1P35821 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ptpn1P35821 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ptpn1P35821 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ptpn1P35821 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Ptpn1P35821 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ptpn1P35821 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ptpn1P35821 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ptpn1P35821 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ptpn1P35821 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ptpn1P35821 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Ptpn1P35821 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ptpn1P35821 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ptpn1P35821 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Ptpn1P35821 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ptpn1P35821 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ptpn1P35821 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ptpn1P35821 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ptpn1P35821 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ptpn1P35821 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ptpn1P35821 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ptpn1P35821 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ptpn1P35821 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ptpn1P35821 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ptpn1P35821 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ptpn1P35821 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ptpn1P35821 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ptpn1P35821 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ptpn1P35821 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ptpn1P35821 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ptpn1P35821 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ptpn1P35821 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ptpn1P35821 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ptpn1P35821 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ptpn1P35821 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ptpn1P35821 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ptpn1P35821 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ptpn1P35821 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Ptpn1P35821 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Ptpn1P35821 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ptpn1P35821 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Ptpn1P35821 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ptpn1P35821 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ptpn1P35821 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ptpn1P35821 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ptpn1P35821 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ptpn1P35821 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ptpn1P35821 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ptpn1P35821 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ptpn1P35821 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ptpn1P35821 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ptpn1P35821 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ptpn1P35821 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ptpn1P35821 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ptpn1P35821 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ptpn1P35821 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.8 ms