Protein–RNA interactions for Protein: P33215

Nedd1, Protein NEDD1, mousemouse

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nedd1P33215 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nedd1P33215 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Nedd1P33215 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Nedd1P33215 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nedd1P33215 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nedd1P33215 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nedd1P33215 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nedd1P33215 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nedd1P33215 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nedd1P33215 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nedd1P33215 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nedd1P33215 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nedd1P33215 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nedd1P33215 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nedd1P33215 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nedd1P33215 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nedd1P33215 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nedd1P33215 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nedd1P33215 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nedd1P33215 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nedd1P33215 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nedd1P33215 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nedd1P33215 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nedd1P33215 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nedd1P33215 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nedd1P33215 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nedd1P33215 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nedd1P33215 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nedd1P33215 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nedd1P33215 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Nedd1P33215 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Nedd1P33215 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Nedd1P33215 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Nedd1P33215 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nedd1P33215 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nedd1P33215 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nedd1P33215 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nedd1P33215 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nedd1P33215 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nedd1P33215 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Nedd1P33215 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Nedd1P33215 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Nedd1P33215 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
Nedd1P33215 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Nedd1P33215 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Nedd1P33215 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Nedd1P33215 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Nedd1P33215 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nedd1P33215 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nedd1P33215 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nedd1P33215 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nedd1P33215 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nedd1P33215 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nedd1P33215 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nedd1P33215 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nedd1P33215 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Nedd1P33215 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nedd1P33215 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nedd1P33215 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Nedd1P33215 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nedd1P33215 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nedd1P33215 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Nedd1P33215 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nedd1P33215 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nedd1P33215 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nedd1P33215 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nedd1P33215 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nedd1P33215 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nedd1P33215 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nedd1P33215 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nedd1P33215 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nedd1P33215 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nedd1P33215 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Nedd1P33215 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Nedd1P33215 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Nedd1P33215 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nedd1P33215 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nedd1P33215 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nedd1P33215 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nedd1P33215 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nedd1P33215 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nedd1P33215 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Nedd1P33215 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Nedd1P33215 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Nedd1P33215 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Nedd1P33215 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nedd1P33215 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nedd1P33215 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nedd1P33215 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nedd1P33215 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nedd1P33215 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nedd1P33215 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Nedd1P33215 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Nedd1P33215 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Nedd1P33215 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nedd1P33215 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nedd1P33215 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nedd1P33215 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Nedd1P33215 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nedd1P33215 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms