Protein–RNA interactions for Protein: P30204

Msr1, Macrophage scavenger receptor types I and II, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msr1P30204 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Msr1P30204 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Msr1P30204 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Msr1P30204 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Msr1P30204 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Msr1P30204 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Msr1P30204 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Msr1P30204 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Msr1P30204 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Msr1P30204 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Msr1P30204 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Msr1P30204 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Msr1P30204 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Msr1P30204 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Msr1P30204 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Msr1P30204 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Msr1P30204 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Msr1P30204 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Msr1P30204 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Msr1P30204 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Msr1P30204 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Msr1P30204 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Msr1P30204 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Msr1P30204 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Msr1P30204 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Msr1P30204 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Msr1P30204 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Msr1P30204 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Msr1P30204 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Msr1P30204 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Msr1P30204 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Msr1P30204 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Msr1P30204 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Msr1P30204 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Msr1P30204 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Msr1P30204 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Msr1P30204 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Msr1P30204 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Msr1P30204 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Msr1P30204 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Msr1P30204 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Msr1P30204 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Msr1P30204 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Msr1P30204 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Msr1P30204 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Msr1P30204 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Msr1P30204 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Msr1P30204 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Msr1P30204 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Msr1P30204 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Msr1P30204 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Msr1P30204 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Msr1P30204 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Msr1P30204 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Msr1P30204 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Msr1P30204 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Msr1P30204 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Msr1P30204 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Msr1P30204 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Msr1P30204 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Msr1P30204 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Msr1P30204 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Msr1P30204 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Msr1P30204 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Msr1P30204 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Msr1P30204 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Msr1P30204 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Msr1P30204 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Msr1P30204 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Msr1P30204 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Msr1P30204 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Msr1P30204 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Msr1P30204 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Msr1P30204 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Msr1P30204 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Msr1P30204 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Msr1P30204 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Msr1P30204 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Msr1P30204 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Msr1P30204 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Msr1P30204 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Msr1P30204 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Msr1P30204 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Msr1P30204 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Msr1P30204 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Msr1P30204 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Msr1P30204 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Msr1P30204 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Msr1P30204 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Msr1P30204 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Msr1P30204 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Msr1P30204 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Msr1P30204 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Msr1P30204 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Msr1P30204 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Msr1P30204 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Msr1P30204 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Msr1P30204 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Msr1P30204 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Msr1P30204 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.5 ms