Protein–RNA interactions for Protein: P28828

Ptprm, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, mousemouse

Predictions only

Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprmP28828 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PtprmP28828 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PtprmP28828 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PtprmP28828 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PtprmP28828 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PtprmP28828 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PtprmP28828 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PtprmP28828 Rhox2g-201ENSMUST00000115169 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PtprmP28828 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
PtprmP28828 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PtprmP28828 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
PtprmP28828 1700113H08Rik-202ENSMUST00000189456 974 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PtprmP28828 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PtprmP28828 Olfr707-201ENSMUST00000088687 924 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PtprmP28828 Olfr1532-ps1-201ENSMUST00000098140 924 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PtprmP28828 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PtprmP28828 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PtprmP28828 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PtprmP28828 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PtprmP28828 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PtprmP28828 S100a14-202ENSMUST00000167598 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PtprmP28828 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
PtprmP28828 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
PtprmP28828 AC153845.2-201ENSMUST00000217535 673 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PtprmP28828 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PtprmP28828 Mettl5-201ENSMUST00000060447 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PtprmP28828 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PtprmP28828 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PtprmP28828 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PtprmP28828 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PtprmP28828 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PtprmP28828 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
PtprmP28828 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PtprmP28828 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PtprmP28828 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PtprmP28828 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PtprmP28828 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PtprmP28828 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
PtprmP28828 Rpl28-ps3-201ENSMUST00000116058 393 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
PtprmP28828 Gm16570-201ENSMUST00000161951 436 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
PtprmP28828 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PtprmP28828 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PtprmP28828 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PtprmP28828 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PtprmP28828 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PtprmP28828 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PtprmP28828 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PtprmP28828 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PtprmP28828 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PtprmP28828 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PtprmP28828 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PtprmP28828 Gpr31b-201ENSMUST00000091648 960 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PtprmP28828 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PtprmP28828 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PtprmP28828 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PtprmP28828 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PtprmP28828 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PtprmP28828 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PtprmP28828 Gm5940-201ENSMUST00000117582 1068 ntBASIC21.32■■□□□ 1
PtprmP28828 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
PtprmP28828 Gm27572-201ENSMUST00000183702 255 ntBASIC21.32■■□□□ 1
PtprmP28828 Gm35409-201ENSMUST00000196412 1102 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PtprmP28828 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PtprmP28828 Rad51d-202ENSMUST00000021033 1201 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PtprmP28828 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PtprmP28828 Gm7399-201ENSMUST00000032395 858 ntBASIC21.32■■□□□ 1
PtprmP28828 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PtprmP28828 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PtprmP28828 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PtprmP28828 Gm23931-201ENSMUST00000103842 109 ntBASIC21.32■■□□□ 1
PtprmP28828 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PtprmP28828 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PtprmP28828 Gm42791-202ENSMUST00000147473 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PtprmP28828 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC21.32■■□□□ 1
PtprmP28828 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
PtprmP28828 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PtprmP28828 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC21.32■■□□□ 1
PtprmP28828 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PtprmP28828 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PtprmP28828 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PtprmP28828 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
PtprmP28828 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PtprmP28828 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PtprmP28828 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PtprmP28828 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PtprmP28828 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC21.31■■□□□ 1
PtprmP28828 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PtprmP28828 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PtprmP28828 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PtprmP28828 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PtprmP28828 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
PtprmP28828 Gm14723-201ENSMUST00000118686 215 ntBASIC21.31■■□□□ 1
PtprmP28828 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PtprmP28828 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PtprmP28828 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC21.31■■□□□ 1
PtprmP28828 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PtprmP28828 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
PtprmP28828 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PtprmP28828 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PtprmP28828 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
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