Protein–RNA interactions for Protein: P28705

Rxrg, Retinoic acid receptor RXR-gamma, mousemouse

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Length 463 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxrgP28705 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RxrgP28705 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RxrgP28705 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RxrgP28705 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RxrgP28705 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RxrgP28705 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RxrgP28705 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RxrgP28705 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RxrgP28705 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RxrgP28705 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
RxrgP28705 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
RxrgP28705 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
RxrgP28705 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
RxrgP28705 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
RxrgP28705 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
RxrgP28705 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
RxrgP28705 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
RxrgP28705 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
RxrgP28705 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
RxrgP28705 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
RxrgP28705 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
RxrgP28705 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
RxrgP28705 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RxrgP28705 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RxrgP28705 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RxrgP28705 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RxrgP28705 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RxrgP28705 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RxrgP28705 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RxrgP28705 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RxrgP28705 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RxrgP28705 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RxrgP28705 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RxrgP28705 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RxrgP28705 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RxrgP28705 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
RxrgP28705 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RxrgP28705 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RxrgP28705 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RxrgP28705 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RxrgP28705 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RxrgP28705 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RxrgP28705 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RxrgP28705 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RxrgP28705 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RxrgP28705 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RxrgP28705 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RxrgP28705 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RxrgP28705 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RxrgP28705 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RxrgP28705 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RxrgP28705 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RxrgP28705 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RxrgP28705 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RxrgP28705 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RxrgP28705 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RxrgP28705 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RxrgP28705 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RxrgP28705 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
RxrgP28705 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RxrgP28705 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RxrgP28705 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RxrgP28705 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RxrgP28705 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RxrgP28705 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RxrgP28705 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RxrgP28705 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RxrgP28705 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RxrgP28705 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RxrgP28705 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RxrgP28705 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RxrgP28705 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RxrgP28705 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RxrgP28705 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RxrgP28705 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RxrgP28705 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RxrgP28705 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RxrgP28705 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RxrgP28705 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RxrgP28705 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RxrgP28705 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RxrgP28705 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RxrgP28705 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RxrgP28705 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RxrgP28705 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RxrgP28705 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RxrgP28705 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RxrgP28705 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
RxrgP28705 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RxrgP28705 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RxrgP28705 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RxrgP28705 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RxrgP28705 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RxrgP28705 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RxrgP28705 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RxrgP28705 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RxrgP28705 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RxrgP28705 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RxrgP28705 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RxrgP28705 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
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