Protein–RNA interactions for Protein: P28309

Defa2, Alpha-defensin 2, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa2P28309 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Defa2P28309 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Defa2P28309 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Defa2P28309 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Defa2P28309 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Defa2P28309 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Defa2P28309 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Defa2P28309 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Defa2P28309 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Defa2P28309 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Defa2P28309 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Defa2P28309 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Defa2P28309 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Defa2P28309 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Defa2P28309 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
Defa2P28309 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Defa2P28309 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Defa2P28309 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Defa2P28309 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Defa2P28309 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Defa2P28309 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Defa2P28309 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Defa2P28309 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
Defa2P28309 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Defa2P28309 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Defa2P28309 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
Defa2P28309 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Defa2P28309 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Defa2P28309 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Defa2P28309 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Defa2P28309 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Defa2P28309 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Defa2P28309 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Defa2P28309 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Defa2P28309 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Defa2P28309 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Defa2P28309 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Defa2P28309 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Defa2P28309 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Defa2P28309 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Defa2P28309 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Defa2P28309 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Defa2P28309 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Defa2P28309 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Defa2P28309 Ttbk1-203ENSMUST00000225808 8926 ntAPPRIS ALT2 BASIC11□□□□□ -0.65
Defa2P28309 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
Defa2P28309 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
Defa2P28309 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Defa2P28309 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Defa2P28309 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Defa2P28309 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Defa2P28309 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Defa2P28309 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Defa2P28309 Mynn-202ENSMUST00000192715 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Defa2P28309 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Defa2P28309 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Defa2P28309 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Defa2P28309 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Defa2P28309 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Defa2P28309 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Defa2P28309 Unc5d-201ENSMUST00000168630 9220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Defa2P28309 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Defa2P28309 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Defa2P28309 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Defa2P28309 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Defa2P28309 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Defa2P28309 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Defa2P28309 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Defa2P28309 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Defa2P28309 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Defa2P28309 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Defa2P28309 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Defa2P28309 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Defa2P28309 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Defa2P28309 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Defa2P28309 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Defa2P28309 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Defa2P28309 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Defa2P28309 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Defa2P28309 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Defa2P28309 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Defa2P28309 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Defa2P28309 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Defa2P28309 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Defa2P28309 Cacna1g-204ENSMUST00000107785 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Defa2P28309 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Defa2P28309 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Defa2P28309 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Defa2P28309 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Defa2P28309 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Defa2P28309 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Defa2P28309 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Defa2P28309 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Defa2P28309 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Defa2P28309 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Defa2P28309 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Defa2P28309 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Defa2P28309 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Defa2P28309 Myh2-203ENSMUST00000170159 6083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Defa2P28309 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms