Protein–RNA interactions for Protein: P28230

Gjb1, Gap junction beta-1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb1P28230 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gjb1P28230 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Gjb1P28230 Gas5-210ENSMUST00000159706 557 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gjb1P28230 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Gjb1P28230 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gjb1P28230 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Gjb1P28230 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gjb1P28230 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gjb1P28230 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gjb1P28230 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gjb1P28230 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Gjb1P28230 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Gjb1P28230 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Gjb1P28230 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Gjb1P28230 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Gjb1P28230 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Gjb1P28230 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Gjb1P28230 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Gjb1P28230 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gjb1P28230 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gjb1P28230 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gjb1P28230 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gjb1P28230 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gjb1P28230 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gjb1P28230 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gjb1P28230 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gjb1P28230 Crym-201ENSMUST00000033198 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gjb1P28230 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gjb1P28230 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Gjb1P28230 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Gjb1P28230 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gjb1P28230 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gjb1P28230 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gjb1P28230 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gjb1P28230 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gjb1P28230 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gjb1P28230 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gjb1P28230 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gjb1P28230 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gjb1P28230 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Gjb1P28230 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gjb1P28230 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Gjb1P28230 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gjb1P28230 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gjb1P28230 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gjb1P28230 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gjb1P28230 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gjb1P28230 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gjb1P28230 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gjb1P28230 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gjb1P28230 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gjb1P28230 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gjb1P28230 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gjb1P28230 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gjb1P28230 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Gjb1P28230 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gjb1P28230 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Gjb1P28230 Mir6420-201ENSMUST00000185032 102 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Gjb1P28230 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gjb1P28230 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gjb1P28230 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gjb1P28230 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gjb1P28230 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gjb1P28230 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gjb1P28230 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gjb1P28230 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gjb1P28230 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gjb1P28230 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gjb1P28230 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gjb1P28230 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gjb1P28230 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gjb1P28230 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gjb1P28230 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gjb1P28230 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gjb1P28230 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gjb1P28230 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gjb1P28230 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Gjb1P28230 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gjb1P28230 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gjb1P28230 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gjb1P28230 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Gjb1P28230 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gjb1P28230 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gjb1P28230 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gjb1P28230 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gjb1P28230 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gjb1P28230 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gjb1P28230 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gjb1P28230 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gjb1P28230 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gjb1P28230 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gjb1P28230 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gjb1P28230 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gjb1P28230 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gjb1P28230 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gjb1P28230 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gjb1P28230 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gjb1P28230 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gjb1P28230 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gjb1P28230 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms