Protein–RNA interactions for Protein: P27870

Vav1, Proto-oncogene vav, mousemouse

Predictions only

Length 845 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vav1P27870 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vav1P27870 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vav1P27870 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vav1P27870 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vav1P27870 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vav1P27870 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vav1P27870 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vav1P27870 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vav1P27870 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vav1P27870 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vav1P27870 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vav1P27870 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vav1P27870 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vav1P27870 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vav1P27870 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vav1P27870 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vav1P27870 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vav1P27870 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vav1P27870 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vav1P27870 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vav1P27870 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vav1P27870 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vav1P27870 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vav1P27870 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Vav1P27870 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vav1P27870 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vav1P27870 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Vav1P27870 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vav1P27870 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vav1P27870 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Vav1P27870 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vav1P27870 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vav1P27870 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vav1P27870 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vav1P27870 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vav1P27870 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vav1P27870 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vav1P27870 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vav1P27870 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Vav1P27870 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vav1P27870 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vav1P27870 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vav1P27870 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Vav1P27870 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vav1P27870 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vav1P27870 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vav1P27870 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Vav1P27870 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Vav1P27870 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vav1P27870 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vav1P27870 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vav1P27870 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vav1P27870 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vav1P27870 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vav1P27870 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Vav1P27870 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vav1P27870 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vav1P27870 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vav1P27870 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vav1P27870 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vav1P27870 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Vav1P27870 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vav1P27870 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vav1P27870 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vav1P27870 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Vav1P27870 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vav1P27870 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vav1P27870 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vav1P27870 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vav1P27870 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vav1P27870 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vav1P27870 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vav1P27870 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vav1P27870 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vav1P27870 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vav1P27870 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vav1P27870 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vav1P27870 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vav1P27870 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vav1P27870 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vav1P27870 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vav1P27870 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vav1P27870 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vav1P27870 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vav1P27870 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vav1P27870 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vav1P27870 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vav1P27870 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vav1P27870 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vav1P27870 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vav1P27870 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vav1P27870 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vav1P27870 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vav1P27870 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vav1P27870 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vav1P27870 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vav1P27870 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vav1P27870 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vav1P27870 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vav1P27870 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.4 ms