Protein–RNA interactions for Protein: P27661

H2afx, Histone H2AX, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 143 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2afxP27661 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
H2afxP27661 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
H2afxP27661 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
H2afxP27661 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
H2afxP27661 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
H2afxP27661 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
H2afxP27661 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
H2afxP27661 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
H2afxP27661 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
H2afxP27661 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
H2afxP27661 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
H2afxP27661 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
H2afxP27661 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
H2afxP27661 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
H2afxP27661 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
H2afxP27661 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
H2afxP27661 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
H2afxP27661 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
H2afxP27661 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
H2afxP27661 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
H2afxP27661 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
H2afxP27661 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
H2afxP27661 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
H2afxP27661 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
H2afxP27661 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
H2afxP27661 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
H2afxP27661 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
H2afxP27661 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
H2afxP27661 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
H2afxP27661 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
H2afxP27661 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
H2afxP27661 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
H2afxP27661 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
H2afxP27661 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
H2afxP27661 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
H2afxP27661 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
H2afxP27661 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
H2afxP27661 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
H2afxP27661 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
H2afxP27661 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
H2afxP27661 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
H2afxP27661 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
H2afxP27661 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
H2afxP27661 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
H2afxP27661 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
H2afxP27661 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
H2afxP27661 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
H2afxP27661 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
H2afxP27661 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
H2afxP27661 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
H2afxP27661 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
H2afxP27661 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
H2afxP27661 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
H2afxP27661 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
H2afxP27661 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
H2afxP27661 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
H2afxP27661 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
H2afxP27661 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
H2afxP27661 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
H2afxP27661 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
H2afxP27661 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
H2afxP27661 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
H2afxP27661 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
H2afxP27661 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
H2afxP27661 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
H2afxP27661 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
H2afxP27661 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
H2afxP27661 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
H2afxP27661 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
H2afxP27661 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
H2afxP27661 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
H2afxP27661 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
H2afxP27661 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
H2afxP27661 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
H2afxP27661 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
H2afxP27661 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
H2afxP27661 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
H2afxP27661 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
H2afxP27661 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
H2afxP27661 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
H2afxP27661 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
H2afxP27661 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
H2afxP27661 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
H2afxP27661 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
H2afxP27661 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
H2afxP27661 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
H2afxP27661 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
H2afxP27661 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
H2afxP27661 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
H2afxP27661 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
H2afxP27661 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
H2afxP27661 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
H2afxP27661 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
H2afxP27661 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
H2afxP27661 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
H2afxP27661 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
H2afxP27661 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
H2afxP27661 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
H2afxP27661 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
H2afxP27661 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms