Protein–RNA interactions for Protein: P26361

Cftr, Cystic fibrosis transmembrane conductance regulator, mousemouse

Predictions only

Length 1,476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CftrP26361 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
CftrP26361 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CftrP26361 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CftrP26361 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CftrP26361 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
CftrP26361 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CftrP26361 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CftrP26361 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CftrP26361 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CftrP26361 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CftrP26361 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CftrP26361 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
CftrP26361 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
CftrP26361 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CftrP26361 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CftrP26361 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CftrP26361 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CftrP26361 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
CftrP26361 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CftrP26361 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CftrP26361 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
CftrP26361 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CftrP26361 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CftrP26361 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
CftrP26361 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CftrP26361 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CftrP26361 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CftrP26361 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CftrP26361 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CftrP26361 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CftrP26361 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CftrP26361 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CftrP26361 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CftrP26361 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
CftrP26361 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
CftrP26361 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
CftrP26361 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CftrP26361 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CftrP26361 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CftrP26361 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CftrP26361 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CftrP26361 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CftrP26361 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CftrP26361 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CftrP26361 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CftrP26361 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
CftrP26361 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CftrP26361 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CftrP26361 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CftrP26361 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CftrP26361 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CftrP26361 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CftrP26361 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CftrP26361 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CftrP26361 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CftrP26361 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CftrP26361 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
CftrP26361 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
CftrP26361 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
CftrP26361 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CftrP26361 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CftrP26361 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
CftrP26361 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CftrP26361 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CftrP26361 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CftrP26361 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CftrP26361 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CftrP26361 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CftrP26361 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CftrP26361 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CftrP26361 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CftrP26361 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CftrP26361 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
CftrP26361 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CftrP26361 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CftrP26361 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
CftrP26361 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CftrP26361 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CftrP26361 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CftrP26361 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CftrP26361 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
CftrP26361 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
CftrP26361 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
CftrP26361 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
CftrP26361 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
CftrP26361 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
CftrP26361 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CftrP26361 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CftrP26361 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CftrP26361 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CftrP26361 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CftrP26361 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CftrP26361 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CftrP26361 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
CftrP26361 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CftrP26361 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CftrP26361 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CftrP26361 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CftrP26361 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CftrP26361 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.7 ms