Protein–RNA interactions for Protein: P26339

Chga, Chromogranin-A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 463 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChgaP26339 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ChgaP26339 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ChgaP26339 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ChgaP26339 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ChgaP26339 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ChgaP26339 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ChgaP26339 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ChgaP26339 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ChgaP26339 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ChgaP26339 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
ChgaP26339 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ChgaP26339 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ChgaP26339 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ChgaP26339 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ChgaP26339 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ChgaP26339 Gm37744-201ENSMUST00000194616 1590 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
ChgaP26339 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ChgaP26339 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ChgaP26339 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ChgaP26339 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ChgaP26339 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
ChgaP26339 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ChgaP26339 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ChgaP26339 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ChgaP26339 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
ChgaP26339 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ChgaP26339 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ChgaP26339 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ChgaP26339 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ChgaP26339 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ChgaP26339 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ChgaP26339 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ChgaP26339 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ChgaP26339 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ChgaP26339 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ChgaP26339 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
ChgaP26339 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ChgaP26339 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ChgaP26339 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ChgaP26339 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ChgaP26339 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ChgaP26339 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ChgaP26339 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ChgaP26339 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ChgaP26339 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ChgaP26339 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ChgaP26339 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ChgaP26339 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ChgaP26339 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ChgaP26339 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ChgaP26339 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
ChgaP26339 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ChgaP26339 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ChgaP26339 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ChgaP26339 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ChgaP26339 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ChgaP26339 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ChgaP26339 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ChgaP26339 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ChgaP26339 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ChgaP26339 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ChgaP26339 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ChgaP26339 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ChgaP26339 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ChgaP26339 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ChgaP26339 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ChgaP26339 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ChgaP26339 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ChgaP26339 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ChgaP26339 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ChgaP26339 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ChgaP26339 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ChgaP26339 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ChgaP26339 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ChgaP26339 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ChgaP26339 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
ChgaP26339 AC132260.2-201ENSMUST00000224482 344 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
ChgaP26339 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ChgaP26339 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ChgaP26339 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ChgaP26339 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ChgaP26339 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ChgaP26339 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ChgaP26339 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ChgaP26339 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ChgaP26339 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ChgaP26339 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ChgaP26339 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ChgaP26339 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
ChgaP26339 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ChgaP26339 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ChgaP26339 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ChgaP26339 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ChgaP26339 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ChgaP26339 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ChgaP26339 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ChgaP26339 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ChgaP26339 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ChgaP26339 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
ChgaP26339 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms