Protein–RNA interactions for Protein: P25799

Nfkb1, Nuclear factor NF-kappa-B p105 subunit, mousemouse

Predictions only

Length 971 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nfkb1P25799 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
Nfkb1P25799 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.1
Nfkb1P25799 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nfkb1P25799 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nfkb1P25799 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nfkb1P25799 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nfkb1P25799 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nfkb1P25799 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nfkb1P25799 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nfkb1P25799 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nfkb1P25799 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nfkb1P25799 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nfkb1P25799 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nfkb1P25799 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Nfkb1P25799 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Nfkb1P25799 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nfkb1P25799 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nfkb1P25799 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nfkb1P25799 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nfkb1P25799 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nfkb1P25799 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nfkb1P25799 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Nfkb1P25799 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nfkb1P25799 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nfkb1P25799 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nfkb1P25799 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nfkb1P25799 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nfkb1P25799 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nfkb1P25799 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nfkb1P25799 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nfkb1P25799 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nfkb1P25799 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nfkb1P25799 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nfkb1P25799 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nfkb1P25799 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nfkb1P25799 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nfkb1P25799 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nfkb1P25799 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nfkb1P25799 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nfkb1P25799 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nfkb1P25799 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nfkb1P25799 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nfkb1P25799 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nfkb1P25799 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nfkb1P25799 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nfkb1P25799 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nfkb1P25799 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Nfkb1P25799 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Nfkb1P25799 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nfkb1P25799 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nfkb1P25799 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nfkb1P25799 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nfkb1P25799 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nfkb1P25799 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nfkb1P25799 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nfkb1P25799 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nfkb1P25799 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nfkb1P25799 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nfkb1P25799 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nfkb1P25799 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nfkb1P25799 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nfkb1P25799 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Nfkb1P25799 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nfkb1P25799 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nfkb1P25799 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nfkb1P25799 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nfkb1P25799 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nfkb1P25799 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nfkb1P25799 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nfkb1P25799 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nfkb1P25799 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nfkb1P25799 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nfkb1P25799 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nfkb1P25799 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nfkb1P25799 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nfkb1P25799 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nfkb1P25799 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nfkb1P25799 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nfkb1P25799 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nfkb1P25799 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nfkb1P25799 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nfkb1P25799 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nfkb1P25799 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nfkb1P25799 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nfkb1P25799 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nfkb1P25799 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nfkb1P25799 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nfkb1P25799 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nfkb1P25799 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Nfkb1P25799 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nfkb1P25799 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nfkb1P25799 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nfkb1P25799 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nfkb1P25799 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nfkb1P25799 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nfkb1P25799 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Nfkb1P25799 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nfkb1P25799 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nfkb1P25799 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nfkb1P25799 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms