Protein–RNA interactions for Protein: P24161

Cd247, T-cell surface glycoprotein CD3 zeta chain, mousemouse

Predictions only

Length 164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd247P24161 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cd247P24161 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cd247P24161 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cd247P24161 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cd247P24161 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cd247P24161 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cd247P24161 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cd247P24161 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cd247P24161 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cd247P24161 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cd247P24161 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cd247P24161 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cd247P24161 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cd247P24161 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cd247P24161 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cd247P24161 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cd247P24161 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Cd247P24161 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cd247P24161 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Cd247P24161 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cd247P24161 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Cd247P24161 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cd247P24161 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Cd247P24161 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cd247P24161 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cd247P24161 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cd247P24161 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cd247P24161 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cd247P24161 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cd247P24161 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cd247P24161 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cd247P24161 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cd247P24161 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cd247P24161 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cd247P24161 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cd247P24161 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cd247P24161 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cd247P24161 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cd247P24161 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cd247P24161 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cd247P24161 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cd247P24161 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cd247P24161 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cd247P24161 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cd247P24161 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Cd247P24161 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cd247P24161 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cd247P24161 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cd247P24161 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Cd247P24161 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Cd247P24161 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cd247P24161 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Cd247P24161 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cd247P24161 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cd247P24161 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cd247P24161 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cd247P24161 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cd247P24161 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cd247P24161 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cd247P24161 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cd247P24161 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cd247P24161 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cd247P24161 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cd247P24161 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cd247P24161 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cd247P24161 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Cd247P24161 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Cd247P24161 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cd247P24161 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cd247P24161 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cd247P24161 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cd247P24161 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cd247P24161 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cd247P24161 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cd247P24161 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cd247P24161 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cd247P24161 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cd247P24161 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cd247P24161 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cd247P24161 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cd247P24161 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cd247P24161 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cd247P24161 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cd247P24161 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cd247P24161 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cd247P24161 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Cd247P24161 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cd247P24161 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Cd247P24161 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cd247P24161 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cd247P24161 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cd247P24161 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cd247P24161 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cd247P24161 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cd247P24161 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cd247P24161 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cd247P24161 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cd247P24161 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cd247P24161 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cd247P24161 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms