Protein–RNA interactions for Protein: P23298

Prkch, Protein kinase C eta type, mousemouse

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Length 683 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkchP23298 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PrkchP23298 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PrkchP23298 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PrkchP23298 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PrkchP23298 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
PrkchP23298 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
PrkchP23298 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
PrkchP23298 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PrkchP23298 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PrkchP23298 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PrkchP23298 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
PrkchP23298 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
PrkchP23298 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PrkchP23298 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
PrkchP23298 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PrkchP23298 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PrkchP23298 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PrkchP23298 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PrkchP23298 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PrkchP23298 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PrkchP23298 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PrkchP23298 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PrkchP23298 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PrkchP23298 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PrkchP23298 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PrkchP23298 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PrkchP23298 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
PrkchP23298 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PrkchP23298 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PrkchP23298 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PrkchP23298 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PrkchP23298 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PrkchP23298 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PrkchP23298 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PrkchP23298 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PrkchP23298 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
PrkchP23298 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PrkchP23298 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PrkchP23298 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PrkchP23298 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PrkchP23298 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PrkchP23298 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PrkchP23298 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PrkchP23298 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PrkchP23298 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PrkchP23298 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PrkchP23298 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PrkchP23298 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PrkchP23298 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PrkchP23298 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PrkchP23298 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PrkchP23298 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PrkchP23298 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PrkchP23298 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PrkchP23298 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
PrkchP23298 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PrkchP23298 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
PrkchP23298 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PrkchP23298 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PrkchP23298 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PrkchP23298 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PrkchP23298 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PrkchP23298 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PrkchP23298 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PrkchP23298 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
PrkchP23298 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PrkchP23298 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PrkchP23298 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PrkchP23298 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PrkchP23298 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PrkchP23298 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PrkchP23298 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PrkchP23298 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PrkchP23298 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PrkchP23298 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PrkchP23298 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PrkchP23298 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PrkchP23298 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PrkchP23298 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PrkchP23298 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PrkchP23298 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PrkchP23298 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PrkchP23298 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PrkchP23298 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
PrkchP23298 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PrkchP23298 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PrkchP23298 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PrkchP23298 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PrkchP23298 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PrkchP23298 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PrkchP23298 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PrkchP23298 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
PrkchP23298 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
PrkchP23298 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PrkchP23298 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PrkchP23298 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PrkchP23298 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PrkchP23298 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PrkchP23298 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PrkchP23298 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.7 ms