Protein–RNA interactions for Protein: P23204

Ppara, Peroxisome proliferator-activated receptor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PparaP23204 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PparaP23204 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PparaP23204 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PparaP23204 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PparaP23204 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
PparaP23204 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PparaP23204 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PparaP23204 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PparaP23204 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PparaP23204 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PparaP23204 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PparaP23204 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PparaP23204 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
PparaP23204 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
PparaP23204 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PparaP23204 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PparaP23204 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PparaP23204 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PparaP23204 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PparaP23204 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
PparaP23204 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PparaP23204 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PparaP23204 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PparaP23204 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PparaP23204 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PparaP23204 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PparaP23204 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PparaP23204 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PparaP23204 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PparaP23204 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PparaP23204 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PparaP23204 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PparaP23204 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PparaP23204 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PparaP23204 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
PparaP23204 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PparaP23204 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
PparaP23204 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
PparaP23204 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
PparaP23204 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PparaP23204 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PparaP23204 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PparaP23204 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PparaP23204 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PparaP23204 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PparaP23204 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PparaP23204 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PparaP23204 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PparaP23204 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PparaP23204 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PparaP23204 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PparaP23204 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PparaP23204 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PparaP23204 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PparaP23204 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PparaP23204 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PparaP23204 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PparaP23204 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PparaP23204 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PparaP23204 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PparaP23204 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PparaP23204 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PparaP23204 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PparaP23204 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
PparaP23204 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
PparaP23204 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PparaP23204 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PparaP23204 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
PparaP23204 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PparaP23204 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PparaP23204 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PparaP23204 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PparaP23204 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PparaP23204 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PparaP23204 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PparaP23204 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PparaP23204 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PparaP23204 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PparaP23204 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PparaP23204 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PparaP23204 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PparaP23204 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PparaP23204 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PparaP23204 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PparaP23204 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PparaP23204 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PparaP23204 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PparaP23204 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PparaP23204 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PparaP23204 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PparaP23204 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PparaP23204 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PparaP23204 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PparaP23204 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PparaP23204 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PparaP23204 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
PparaP23204 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PparaP23204 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PparaP23204 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PparaP23204 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.8 ms