Protein–RNA interactions for Protein: P23116

Eif3a, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eif3aP23116 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Eif3aP23116 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Eif3aP23116 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Eif3aP23116 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Eif3aP23116 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Eif3aP23116 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Eif3aP23116 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Eif3aP23116 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Eif3aP23116 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Eif3aP23116 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Eif3aP23116 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Eif3aP23116 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Eif3aP23116 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Eif3aP23116 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Eif3aP23116 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Eif3aP23116 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Eif3aP23116 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Eif3aP23116 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Eif3aP23116 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Eif3aP23116 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Eif3aP23116 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Eif3aP23116 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Eif3aP23116 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Eif3aP23116 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Eif3aP23116 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Eif3aP23116 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Eif3aP23116 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Eif3aP23116 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Eif3aP23116 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Eif3aP23116 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Eif3aP23116 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Eif3aP23116 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Eif3aP23116 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Eif3aP23116 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Eif3aP23116 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Eif3aP23116 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Eif3aP23116 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Eif3aP23116 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Eif3aP23116 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Eif3aP23116 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Eif3aP23116 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Eif3aP23116 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Eif3aP23116 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Eif3aP23116 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Eif3aP23116 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Eif3aP23116 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Eif3aP23116 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Eif3aP23116 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Eif3aP23116 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Eif3aP23116 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Eif3aP23116 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Eif3aP23116 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Eif3aP23116 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Eif3aP23116 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Eif3aP23116 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Eif3aP23116 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Eif3aP23116 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Eif3aP23116 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Eif3aP23116 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Eif3aP23116 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Eif3aP23116 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Eif3aP23116 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Eif3aP23116 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Eif3aP23116 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Eif3aP23116 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Eif3aP23116 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Eif3aP23116 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Eif3aP23116 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Eif3aP23116 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Eif3aP23116 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Eif3aP23116 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Eif3aP23116 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Eif3aP23116 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Eif3aP23116 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Eif3aP23116 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Eif3aP23116 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Eif3aP23116 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Eif3aP23116 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Eif3aP23116 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Eif3aP23116 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Eif3aP23116 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Eif3aP23116 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Eif3aP23116 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Eif3aP23116 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Eif3aP23116 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Eif3aP23116 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Eif3aP23116 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Eif3aP23116 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Eif3aP23116 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Eif3aP23116 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Eif3aP23116 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Eif3aP23116 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Eif3aP23116 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Eif3aP23116 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Eif3aP23116 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Eif3aP23116 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Eif3aP23116 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Eif3aP23116 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Eif3aP23116 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Eif3aP23116 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms