Protein–RNA interactions for Protein: P20444

Prkca, Protein kinase C alpha type, mousemouse

Predictions only

Length 672 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcaP20444 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PrkcaP20444 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
PrkcaP20444 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
PrkcaP20444 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
PrkcaP20444 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
PrkcaP20444 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
PrkcaP20444 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
PrkcaP20444 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PrkcaP20444 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PrkcaP20444 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PrkcaP20444 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
PrkcaP20444 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PrkcaP20444 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PrkcaP20444 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PrkcaP20444 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PrkcaP20444 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
PrkcaP20444 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PrkcaP20444 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PrkcaP20444 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PrkcaP20444 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
PrkcaP20444 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PrkcaP20444 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PrkcaP20444 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PrkcaP20444 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
PrkcaP20444 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PrkcaP20444 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
PrkcaP20444 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PrkcaP20444 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PrkcaP20444 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PrkcaP20444 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PrkcaP20444 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PrkcaP20444 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PrkcaP20444 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PrkcaP20444 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PrkcaP20444 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PrkcaP20444 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PrkcaP20444 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PrkcaP20444 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
PrkcaP20444 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PrkcaP20444 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PrkcaP20444 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PrkcaP20444 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PrkcaP20444 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
PrkcaP20444 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PrkcaP20444 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PrkcaP20444 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
PrkcaP20444 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PrkcaP20444 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PrkcaP20444 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PrkcaP20444 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PrkcaP20444 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
PrkcaP20444 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PrkcaP20444 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PrkcaP20444 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PrkcaP20444 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PrkcaP20444 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
PrkcaP20444 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PrkcaP20444 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PrkcaP20444 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PrkcaP20444 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
PrkcaP20444 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PrkcaP20444 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
PrkcaP20444 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
PrkcaP20444 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
PrkcaP20444 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PrkcaP20444 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PrkcaP20444 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PrkcaP20444 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PrkcaP20444 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
PrkcaP20444 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
PrkcaP20444 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PrkcaP20444 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
PrkcaP20444 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PrkcaP20444 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PrkcaP20444 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PrkcaP20444 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
PrkcaP20444 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PrkcaP20444 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
PrkcaP20444 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
PrkcaP20444 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
PrkcaP20444 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PrkcaP20444 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
PrkcaP20444 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC13.84□□□□□ -0.19
PrkcaP20444 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
PrkcaP20444 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PrkcaP20444 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PrkcaP20444 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
PrkcaP20444 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PrkcaP20444 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PrkcaP20444 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
PrkcaP20444 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
PrkcaP20444 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PrkcaP20444 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PrkcaP20444 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
PrkcaP20444 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
PrkcaP20444 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PrkcaP20444 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PrkcaP20444 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PrkcaP20444 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PrkcaP20444 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC13.83□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.9 ms