Protein–RNA interactions for Protein: P20263

Pou5f1, POU domain, class 5, transcription factor 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 352 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou5f1P20263 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pou5f1P20263 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pou5f1P20263 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pou5f1P20263 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pou5f1P20263 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pou5f1P20263 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pou5f1P20263 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pou5f1P20263 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pou5f1P20263 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pou5f1P20263 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pou5f1P20263 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pou5f1P20263 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pou5f1P20263 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pou5f1P20263 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pou5f1P20263 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pou5f1P20263 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pou5f1P20263 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Pou5f1P20263 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pou5f1P20263 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Pou5f1P20263 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Pou5f1P20263 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Pou5f1P20263 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pou5f1P20263 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pou5f1P20263 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pou5f1P20263 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pou5f1P20263 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pou5f1P20263 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pou5f1P20263 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pou5f1P20263 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pou5f1P20263 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pou5f1P20263 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pou5f1P20263 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pou5f1P20263 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pou5f1P20263 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pou5f1P20263 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pou5f1P20263 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pou5f1P20263 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pou5f1P20263 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pou5f1P20263 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pou5f1P20263 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pou5f1P20263 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Pou5f1P20263 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Pou5f1P20263 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Pou5f1P20263 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Pou5f1P20263 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Pou5f1P20263 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Pou5f1P20263 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Pou5f1P20263 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pou5f1P20263 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pou5f1P20263 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pou5f1P20263 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pou5f1P20263 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pou5f1P20263 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pou5f1P20263 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pou5f1P20263 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pou5f1P20263 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Pou5f1P20263 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Pou5f1P20263 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pou5f1P20263 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pou5f1P20263 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pou5f1P20263 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pou5f1P20263 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pou5f1P20263 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pou5f1P20263 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pou5f1P20263 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pou5f1P20263 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pou5f1P20263 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pou5f1P20263 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pou5f1P20263 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pou5f1P20263 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pou5f1P20263 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pou5f1P20263 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pou5f1P20263 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pou5f1P20263 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pou5f1P20263 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pou5f1P20263 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pou5f1P20263 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pou5f1P20263 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pou5f1P20263 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pou5f1P20263 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pou5f1P20263 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pou5f1P20263 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pou5f1P20263 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Pou5f1P20263 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pou5f1P20263 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pou5f1P20263 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Pou5f1P20263 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pou5f1P20263 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Pou5f1P20263 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pou5f1P20263 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pou5f1P20263 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pou5f1P20263 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Pou5f1P20263 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pou5f1P20263 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pou5f1P20263 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pou5f1P20263 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pou5f1P20263 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pou5f1P20263 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pou5f1P20263 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pou5f1P20263 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.5 ms