Protein–RNA interactions for Protein: P20152

Vim, Vimentin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VimP20152 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
VimP20152 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
VimP20152 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
VimP20152 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
VimP20152 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
VimP20152 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
VimP20152 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
VimP20152 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
VimP20152 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
VimP20152 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
VimP20152 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
VimP20152 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
VimP20152 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
VimP20152 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
VimP20152 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
VimP20152 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
VimP20152 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
VimP20152 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
VimP20152 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
VimP20152 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
VimP20152 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
VimP20152 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VimP20152 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
VimP20152 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
VimP20152 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VimP20152 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VimP20152 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VimP20152 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
VimP20152 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VimP20152 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VimP20152 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VimP20152 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VimP20152 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VimP20152 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VimP20152 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VimP20152 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
VimP20152 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VimP20152 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
VimP20152 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
VimP20152 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VimP20152 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
VimP20152 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
VimP20152 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VimP20152 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
VimP20152 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VimP20152 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
VimP20152 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
VimP20152 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
VimP20152 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
VimP20152 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
VimP20152 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VimP20152 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VimP20152 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VimP20152 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
VimP20152 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VimP20152 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VimP20152 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
VimP20152 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
VimP20152 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
VimP20152 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
VimP20152 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
VimP20152 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
VimP20152 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
VimP20152 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
VimP20152 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
VimP20152 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
VimP20152 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
VimP20152 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
VimP20152 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
VimP20152 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
VimP20152 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
VimP20152 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
VimP20152 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
VimP20152 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
VimP20152 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
VimP20152 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
VimP20152 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
VimP20152 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
VimP20152 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
VimP20152 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
VimP20152 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
VimP20152 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
VimP20152 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
VimP20152 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
VimP20152 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
VimP20152 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
VimP20152 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
VimP20152 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
VimP20152 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
VimP20152 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
VimP20152 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
VimP20152 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
VimP20152 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
VimP20152 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
VimP20152 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
VimP20152 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
VimP20152 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
VimP20152 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
VimP20152 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
VimP20152 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53 ms