Protein–RNA interactions for Protein: P20040

H-2 class II histocompatibility antigen, E-Q beta chain, mousemouse

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Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P20040 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
P20040 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
P20040 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
P20040 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
P20040 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
P20040 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
P20040 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
P20040 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
P20040 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
P20040 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
P20040 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
P20040 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
P20040 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
P20040 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
P20040 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
P20040 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
P20040 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
P20040 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
P20040 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
P20040 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
P20040 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
P20040 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
P20040 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
P20040 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
P20040 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
P20040 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
P20040 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
P20040 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
P20040 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
P20040 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
P20040 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
P20040 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
P20040 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
P20040 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
P20040 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
P20040 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
P20040 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
P20040 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
P20040 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
P20040 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
P20040 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
P20040 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
P20040 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
P20040 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
P20040 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
P20040 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
P20040 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
P20040 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
P20040 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
P20040 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
P20040 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
P20040 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
P20040 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
P20040 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
P20040 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
P20040 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
P20040 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
P20040 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
P20040 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
P20040 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
P20040 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
P20040 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
P20040 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
P20040 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
P20040 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
P20040 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
P20040 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
P20040 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
P20040 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
P20040 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
P20040 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
P20040 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
P20040 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
P20040 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
P20040 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
P20040 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
P20040 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
P20040 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
P20040 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
P20040 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
P20040 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
P20040 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
P20040 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
P20040 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
P20040 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
P20040 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
P20040 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
P20040 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
P20040 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
P20040 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
P20040 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
P20040 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
P20040 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
P20040 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
P20040 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
P20040 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
P20040 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
P20040 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
P20040 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
P20040 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
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