Protein–RNA interactions for Protein: P19246

Nefh, Neurofilament heavy polypeptide, mousemouse

Predictions only

Length 1,090 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NefhP19246 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NefhP19246 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NefhP19246 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NefhP19246 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NefhP19246 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NefhP19246 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NefhP19246 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
NefhP19246 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NefhP19246 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NefhP19246 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NefhP19246 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NefhP19246 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NefhP19246 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NefhP19246 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NefhP19246 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NefhP19246 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NefhP19246 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NefhP19246 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NefhP19246 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
NefhP19246 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NefhP19246 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NefhP19246 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NefhP19246 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NefhP19246 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NefhP19246 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NefhP19246 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NefhP19246 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NefhP19246 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NefhP19246 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NefhP19246 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NefhP19246 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NefhP19246 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NefhP19246 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NefhP19246 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NefhP19246 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NefhP19246 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NefhP19246 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NefhP19246 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NefhP19246 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
NefhP19246 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NefhP19246 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NefhP19246 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NefhP19246 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NefhP19246 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NefhP19246 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NefhP19246 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NefhP19246 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NefhP19246 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NefhP19246 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NefhP19246 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NefhP19246 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
NefhP19246 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
NefhP19246 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NefhP19246 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NefhP19246 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NefhP19246 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NefhP19246 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NefhP19246 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NefhP19246 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NefhP19246 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NefhP19246 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NefhP19246 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
NefhP19246 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
NefhP19246 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NefhP19246 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NefhP19246 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
NefhP19246 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
NefhP19246 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NefhP19246 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NefhP19246 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NefhP19246 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NefhP19246 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NefhP19246 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NefhP19246 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NefhP19246 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NefhP19246 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NefhP19246 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NefhP19246 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
NefhP19246 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NefhP19246 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NefhP19246 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NefhP19246 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NefhP19246 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NefhP19246 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NefhP19246 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NefhP19246 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NefhP19246 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NefhP19246 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NefhP19246 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
NefhP19246 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NefhP19246 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
NefhP19246 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NefhP19246 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NefhP19246 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NefhP19246 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NefhP19246 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NefhP19246 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NefhP19246 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NefhP19246 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NefhP19246 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.1 ms