Protein–RNA interactions for Protein: P19182

Ifrd1, Interferon-related developmental regulator 1, mousemouse

Predictions only

Length 449 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifrd1P19182 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ifrd1P19182 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ifrd1P19182 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ifrd1P19182 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Ifrd1P19182 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ifrd1P19182 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ifrd1P19182 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ifrd1P19182 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ifrd1P19182 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ifrd1P19182 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ifrd1P19182 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ifrd1P19182 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ifrd1P19182 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ifrd1P19182 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ifrd1P19182 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ifrd1P19182 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ifrd1P19182 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ifrd1P19182 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ifrd1P19182 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ifrd1P19182 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ifrd1P19182 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ifrd1P19182 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ifrd1P19182 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ifrd1P19182 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ifrd1P19182 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ifrd1P19182 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ifrd1P19182 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ifrd1P19182 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ifrd1P19182 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ifrd1P19182 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ifrd1P19182 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ifrd1P19182 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Ifrd1P19182 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ifrd1P19182 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Ifrd1P19182 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ifrd1P19182 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ifrd1P19182 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ifrd1P19182 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ifrd1P19182 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ifrd1P19182 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ifrd1P19182 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ifrd1P19182 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ifrd1P19182 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ifrd1P19182 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ifrd1P19182 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ifrd1P19182 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ifrd1P19182 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ifrd1P19182 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ifrd1P19182 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ifrd1P19182 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ifrd1P19182 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ifrd1P19182 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ifrd1P19182 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ifrd1P19182 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ifrd1P19182 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ifrd1P19182 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ifrd1P19182 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Ifrd1P19182 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Ifrd1P19182 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Ifrd1P19182 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ifrd1P19182 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Ifrd1P19182 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ifrd1P19182 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ifrd1P19182 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ifrd1P19182 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ifrd1P19182 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ifrd1P19182 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ifrd1P19182 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ifrd1P19182 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ifrd1P19182 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ifrd1P19182 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ifrd1P19182 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ifrd1P19182 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ifrd1P19182 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ifrd1P19182 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ifrd1P19182 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ifrd1P19182 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ifrd1P19182 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ifrd1P19182 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ifrd1P19182 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ifrd1P19182 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Ifrd1P19182 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ifrd1P19182 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ifrd1P19182 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ifrd1P19182 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ifrd1P19182 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ifrd1P19182 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ifrd1P19182 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ifrd1P19182 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ifrd1P19182 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ifrd1P19182 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ifrd1P19182 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ifrd1P19182 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ifrd1P19182 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ifrd1P19182 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ifrd1P19182 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ifrd1P19182 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ifrd1P19182 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ifrd1P19182 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ifrd1P19182 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms