Protein–RNA interactions for Protein: P18526

Ig heavy chain V region 345, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18526 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
P18526 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
P18526 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
P18526 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
P18526 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
P18526 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
P18526 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
P18526 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
P18526 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
P18526 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
P18526 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
P18526 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
P18526 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
P18526 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
P18526 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
P18526 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
P18526 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
P18526 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
P18526 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
P18526 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
P18526 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
P18526 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
P18526 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
P18526 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
P18526 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
P18526 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
P18526 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
P18526 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
P18526 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
P18526 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
P18526 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
P18526 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
P18526 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
P18526 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
P18526 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
P18526 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
P18526 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
P18526 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
P18526 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
P18526 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
P18526 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
P18526 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
P18526 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
P18526 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
P18526 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
P18526 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
P18526 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
P18526 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
P18526 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
P18526 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
P18526 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
P18526 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
P18526 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
P18526 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
P18526 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
P18526 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
P18526 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
P18526 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
P18526 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
P18526 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
P18526 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
P18526 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
P18526 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
P18526 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
P18526 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
P18526 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
P18526 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
P18526 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
P18526 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
P18526 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
P18526 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
P18526 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
P18526 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
P18526 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
P18526 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
P18526 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
P18526 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
P18526 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
P18526 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
P18526 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
P18526 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
P18526 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
P18526 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
P18526 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
P18526 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
P18526 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
P18526 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
P18526 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
P18526 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
P18526 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
P18526 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
P18526 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
P18526 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
P18526 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
P18526 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
P18526 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
P18526 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
P18526 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
P18526 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
P18526 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
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