Protein–RNA interactions for Protein: P18242

Ctsd, Cathepsin D, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 410 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtsdP18242 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CtsdP18242 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CtsdP18242 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CtsdP18242 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
CtsdP18242 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CtsdP18242 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CtsdP18242 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CtsdP18242 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CtsdP18242 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CtsdP18242 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CtsdP18242 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CtsdP18242 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CtsdP18242 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CtsdP18242 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CtsdP18242 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CtsdP18242 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CtsdP18242 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CtsdP18242 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CtsdP18242 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CtsdP18242 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CtsdP18242 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CtsdP18242 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CtsdP18242 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CtsdP18242 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CtsdP18242 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CtsdP18242 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CtsdP18242 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CtsdP18242 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CtsdP18242 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
CtsdP18242 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CtsdP18242 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
CtsdP18242 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
CtsdP18242 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
CtsdP18242 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CtsdP18242 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
CtsdP18242 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC15.02■□□□□ -0
CtsdP18242 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
CtsdP18242 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC15.02■□□□□ -0
CtsdP18242 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CtsdP18242 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CtsdP18242 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CtsdP18242 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
CtsdP18242 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
CtsdP18242 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
CtsdP18242 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CtsdP18242 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CtsdP18242 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CtsdP18242 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CtsdP18242 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
CtsdP18242 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CtsdP18242 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
CtsdP18242 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC15.02□□□□□ -0.01
CtsdP18242 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CtsdP18242 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CtsdP18242 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CtsdP18242 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CtsdP18242 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CtsdP18242 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CtsdP18242 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CtsdP18242 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CtsdP18242 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CtsdP18242 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CtsdP18242 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CtsdP18242 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CtsdP18242 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CtsdP18242 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CtsdP18242 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CtsdP18242 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CtsdP18242 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CtsdP18242 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CtsdP18242 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CtsdP18242 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
CtsdP18242 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CtsdP18242 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CtsdP18242 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CtsdP18242 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CtsdP18242 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CtsdP18242 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CtsdP18242 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CtsdP18242 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CtsdP18242 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CtsdP18242 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CtsdP18242 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CtsdP18242 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CtsdP18242 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CtsdP18242 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CtsdP18242 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CtsdP18242 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CtsdP18242 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CtsdP18242 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CtsdP18242 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC15□□□□□ -0.01
CtsdP18242 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CtsdP18242 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CtsdP18242 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CtsdP18242 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CtsdP18242 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CtsdP18242 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CtsdP18242 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CtsdP18242 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CtsdP18242 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC15□□□□□ -0.01
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