Protein–RNA interactions for Protein: P16460

Ass1, Argininosuccinate synthase, mousemouse

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ass1P16460 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ass1P16460 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ass1P16460 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ass1P16460 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ass1P16460 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ass1P16460 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ass1P16460 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ass1P16460 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ass1P16460 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ass1P16460 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ass1P16460 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ass1P16460 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ass1P16460 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ass1P16460 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ass1P16460 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ass1P16460 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ass1P16460 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ass1P16460 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ass1P16460 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ass1P16460 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ass1P16460 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ass1P16460 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ass1P16460 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ass1P16460 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ass1P16460 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ass1P16460 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ass1P16460 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ass1P16460 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ass1P16460 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ass1P16460 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ass1P16460 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ass1P16460 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ass1P16460 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ass1P16460 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ass1P16460 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ass1P16460 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ass1P16460 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ass1P16460 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ass1P16460 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ass1P16460 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ass1P16460 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ass1P16460 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ass1P16460 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ass1P16460 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Ass1P16460 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ass1P16460 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ass1P16460 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ass1P16460 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ass1P16460 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ass1P16460 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ass1P16460 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ass1P16460 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ass1P16460 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Ass1P16460 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ass1P16460 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ass1P16460 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ass1P16460 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ass1P16460 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ass1P16460 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ass1P16460 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ass1P16460 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ass1P16460 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ass1P16460 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ass1P16460 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ass1P16460 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ass1P16460 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ass1P16460 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Ass1P16460 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Ass1P16460 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Ass1P16460 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ass1P16460 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ass1P16460 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ass1P16460 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ass1P16460 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ass1P16460 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ass1P16460 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ass1P16460 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ass1P16460 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ass1P16460 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ass1P16460 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ass1P16460 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ass1P16460 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ass1P16460 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ass1P16460 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ass1P16460 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ass1P16460 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ass1P16460 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ass1P16460 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ass1P16460 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ass1P16460 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Ass1P16460 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ass1P16460 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Ass1P16460 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ass1P16460 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ass1P16460 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ass1P16460 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ass1P16460 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ass1P16460 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ass1P16460 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ass1P16460 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms