Protein–RNA interactions for Protein: P15975

Usp53, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 53, mousemouse

Predictions only

Length 1,069 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp53P15975 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Usp53P15975 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Usp53P15975 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Usp53P15975 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Usp53P15975 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Usp53P15975 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Usp53P15975 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Usp53P15975 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Usp53P15975 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Usp53P15975 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Usp53P15975 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Usp53P15975 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Usp53P15975 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Usp53P15975 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Usp53P15975 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Usp53P15975 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Usp53P15975 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Usp53P15975 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Usp53P15975 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Usp53P15975 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Usp53P15975 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Usp53P15975 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Usp53P15975 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Usp53P15975 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Usp53P15975 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Usp53P15975 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Usp53P15975 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Usp53P15975 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Usp53P15975 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Usp53P15975 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Usp53P15975 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Usp53P15975 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Usp53P15975 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Usp53P15975 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Usp53P15975 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Usp53P15975 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Usp53P15975 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Usp53P15975 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Usp53P15975 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Usp53P15975 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Usp53P15975 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Usp53P15975 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Usp53P15975 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Usp53P15975 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Usp53P15975 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Usp53P15975 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Usp53P15975 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Usp53P15975 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Usp53P15975 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Usp53P15975 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Usp53P15975 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Usp53P15975 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Usp53P15975 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Usp53P15975 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Usp53P15975 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Usp53P15975 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Usp53P15975 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Usp53P15975 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Usp53P15975 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Usp53P15975 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Usp53P15975 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Usp53P15975 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Usp53P15975 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Usp53P15975 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Usp53P15975 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Usp53P15975 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Usp53P15975 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Usp53P15975 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Usp53P15975 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Usp53P15975 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Usp53P15975 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Usp53P15975 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Usp53P15975 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Usp53P15975 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Usp53P15975 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Usp53P15975 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Usp53P15975 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Usp53P15975 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Usp53P15975 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Usp53P15975 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Usp53P15975 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Usp53P15975 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Usp53P15975 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Usp53P15975 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Usp53P15975 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Usp53P15975 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Usp53P15975 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Usp53P15975 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Usp53P15975 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Usp53P15975 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Usp53P15975 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Usp53P15975 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Usp53P15975 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Usp53P15975 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Usp53P15975 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Usp53P15975 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Usp53P15975 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Usp53P15975 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Usp53P15975 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Usp53P15975 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms