Protein–RNA interactions for Protein: P15919

Rag1, V(D)J recombination-activating protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,040 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rag1P15919 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Rag1P15919 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Rag1P15919 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Rag1P15919 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Rag1P15919 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Rag1P15919 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Rag1P15919 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rag1P15919 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rag1P15919 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rag1P15919 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Rag1P15919 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Rag1P15919 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rag1P15919 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rag1P15919 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rag1P15919 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rag1P15919 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rag1P15919 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rag1P15919 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rag1P15919 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rag1P15919 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rag1P15919 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rag1P15919 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rag1P15919 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rag1P15919 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rag1P15919 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rag1P15919 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rag1P15919 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rag1P15919 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rag1P15919 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rag1P15919 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rag1P15919 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rag1P15919 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rag1P15919 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rag1P15919 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rag1P15919 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rag1P15919 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rag1P15919 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rag1P15919 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rag1P15919 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rag1P15919 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rag1P15919 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rag1P15919 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rag1P15919 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rag1P15919 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Rag1P15919 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rag1P15919 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Rag1P15919 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rag1P15919 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rag1P15919 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rag1P15919 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rag1P15919 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rag1P15919 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rag1P15919 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rag1P15919 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rag1P15919 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rag1P15919 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rag1P15919 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rag1P15919 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rag1P15919 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rag1P15919 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rag1P15919 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rag1P15919 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rag1P15919 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rag1P15919 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rag1P15919 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rag1P15919 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rag1P15919 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rag1P15919 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rag1P15919 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rag1P15919 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rag1P15919 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rag1P15919 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rag1P15919 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rag1P15919 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Rag1P15919 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rag1P15919 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rag1P15919 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rag1P15919 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rag1P15919 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rag1P15919 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rag1P15919 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rag1P15919 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rag1P15919 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Rag1P15919 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rag1P15919 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rag1P15919 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rag1P15919 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rag1P15919 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rag1P15919 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rag1P15919 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rag1P15919 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rag1P15919 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rag1P15919 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rag1P15919 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rag1P15919 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rag1P15919 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rag1P15919 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rag1P15919 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rag1P15919 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rag1P15919 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.3 ms