Protein–RNA interactions for Protein: P13372

Vpreb1, Immunoglobulin iota chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb1P13372 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Vpreb1P13372 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Vpreb1P13372 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Vpreb1P13372 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Vpreb1P13372 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Vpreb1P13372 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Vpreb1P13372 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Vpreb1P13372 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Vpreb1P13372 Rbm47-204ENSMUST00000113726 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Vpreb1P13372 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Vpreb1P13372 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Vpreb1P13372 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Vpreb1P13372 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Vpreb1P13372 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Vpreb1P13372 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Vpreb1P13372 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Vpreb1P13372 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Vpreb1P13372 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
Vpreb1P13372 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
Vpreb1P13372 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Vpreb1P13372 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Vpreb1P13372 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Vpreb1P13372 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Vpreb1P13372 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Vpreb1P13372 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Vpreb1P13372 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Vpreb1P13372 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Vpreb1P13372 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Vpreb1P13372 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Vpreb1P13372 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Vpreb1P13372 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Vpreb1P13372 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Vpreb1P13372 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Vpreb1P13372 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Vpreb1P13372 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Vpreb1P13372 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Vpreb1P13372 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Vpreb1P13372 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Vpreb1P13372 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Vpreb1P13372 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Vpreb1P13372 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Vpreb1P13372 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Vpreb1P13372 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Vpreb1P13372 Zeb2-202ENSMUST00000068415 5624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Vpreb1P13372 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Vpreb1P13372 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Vpreb1P13372 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Vpreb1P13372 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Vpreb1P13372 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Vpreb1P13372 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Vpreb1P13372 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Vpreb1P13372 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Vpreb1P13372 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Vpreb1P13372 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Vpreb1P13372 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Vpreb1P13372 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Vpreb1P13372 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Vpreb1P13372 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Vpreb1P13372 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Vpreb1P13372 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Vpreb1P13372 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Vpreb1P13372 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Vpreb1P13372 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Vpreb1P13372 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Vpreb1P13372 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Vpreb1P13372 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Vpreb1P13372 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Vpreb1P13372 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Vpreb1P13372 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Vpreb1P13372 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Vpreb1P13372 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Vpreb1P13372 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Vpreb1P13372 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Vpreb1P13372 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Vpreb1P13372 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Vpreb1P13372 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Vpreb1P13372 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Vpreb1P13372 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Vpreb1P13372 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Vpreb1P13372 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Vpreb1P13372 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Vpreb1P13372 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Vpreb1P13372 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Vpreb1P13372 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Vpreb1P13372 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Vpreb1P13372 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Vpreb1P13372 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Vpreb1P13372 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Vpreb1P13372 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Vpreb1P13372 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Vpreb1P13372 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Vpreb1P13372 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Vpreb1P13372 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Vpreb1P13372 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Vpreb1P13372 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Vpreb1P13372 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Vpreb1P13372 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Vpreb1P13372 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Vpreb1P13372 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Vpreb1P13372 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms