Protein–RNA interactions for Protein: P11416

Rara, Retinoic acid receptor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 462 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RaraP11416 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RaraP11416 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RaraP11416 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RaraP11416 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RaraP11416 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RaraP11416 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RaraP11416 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RaraP11416 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RaraP11416 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RaraP11416 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RaraP11416 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RaraP11416 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RaraP11416 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RaraP11416 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RaraP11416 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RaraP11416 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RaraP11416 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RaraP11416 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RaraP11416 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RaraP11416 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RaraP11416 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RaraP11416 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RaraP11416 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RaraP11416 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RaraP11416 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RaraP11416 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RaraP11416 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RaraP11416 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RaraP11416 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RaraP11416 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RaraP11416 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RaraP11416 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RaraP11416 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RaraP11416 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RaraP11416 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RaraP11416 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RaraP11416 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RaraP11416 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RaraP11416 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RaraP11416 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RaraP11416 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RaraP11416 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RaraP11416 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RaraP11416 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RaraP11416 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RaraP11416 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RaraP11416 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RaraP11416 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RaraP11416 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RaraP11416 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RaraP11416 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RaraP11416 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RaraP11416 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RaraP11416 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RaraP11416 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
RaraP11416 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RaraP11416 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RaraP11416 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RaraP11416 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RaraP11416 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RaraP11416 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RaraP11416 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RaraP11416 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RaraP11416 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RaraP11416 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RaraP11416 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RaraP11416 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RaraP11416 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RaraP11416 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
RaraP11416 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RaraP11416 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RaraP11416 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RaraP11416 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RaraP11416 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RaraP11416 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RaraP11416 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RaraP11416 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RaraP11416 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RaraP11416 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RaraP11416 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RaraP11416 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RaraP11416 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RaraP11416 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RaraP11416 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RaraP11416 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RaraP11416 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RaraP11416 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RaraP11416 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RaraP11416 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RaraP11416 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RaraP11416 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RaraP11416 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RaraP11416 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RaraP11416 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RaraP11416 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RaraP11416 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RaraP11416 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RaraP11416 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RaraP11416 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RaraP11416 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms