Protein–RNA interactions for Protein: P10820

Prf1, Perforin-1, mousemouse

Predictions only

Length 554 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prf1P10820 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prf1P10820 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prf1P10820 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prf1P10820 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prf1P10820 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prf1P10820 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prf1P10820 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prf1P10820 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prf1P10820 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prf1P10820 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prf1P10820 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prf1P10820 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Prf1P10820 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prf1P10820 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prf1P10820 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Prf1P10820 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prf1P10820 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prf1P10820 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prf1P10820 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prf1P10820 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prf1P10820 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prf1P10820 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prf1P10820 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prf1P10820 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prf1P10820 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prf1P10820 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prf1P10820 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prf1P10820 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prf1P10820 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prf1P10820 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prf1P10820 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prf1P10820 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prf1P10820 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prf1P10820 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prf1P10820 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prf1P10820 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prf1P10820 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prf1P10820 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prf1P10820 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prf1P10820 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prf1P10820 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prf1P10820 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prf1P10820 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prf1P10820 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prf1P10820 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prf1P10820 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prf1P10820 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prf1P10820 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prf1P10820 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prf1P10820 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prf1P10820 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prf1P10820 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prf1P10820 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prf1P10820 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prf1P10820 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prf1P10820 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Prf1P10820 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prf1P10820 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prf1P10820 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prf1P10820 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Prf1P10820 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prf1P10820 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prf1P10820 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prf1P10820 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prf1P10820 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prf1P10820 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prf1P10820 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prf1P10820 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prf1P10820 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prf1P10820 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prf1P10820 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prf1P10820 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prf1P10820 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prf1P10820 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prf1P10820 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prf1P10820 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prf1P10820 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prf1P10820 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prf1P10820 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prf1P10820 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prf1P10820 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prf1P10820 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prf1P10820 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prf1P10820 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Prf1P10820 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prf1P10820 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prf1P10820 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prf1P10820 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prf1P10820 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prf1P10820 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prf1P10820 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prf1P10820 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prf1P10820 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Prf1P10820 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prf1P10820 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prf1P10820 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Prf1P10820 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prf1P10820 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prf1P10820 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prf1P10820 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms