Protein–RNA interactions for Protein: P10404

MLV-related proviral Env polyprotein, mousemouse

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Length 641 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P10404 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
P10404 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
P10404 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
P10404 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
P10404 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
P10404 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
P10404 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
P10404 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
P10404 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
P10404 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
P10404 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
P10404 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
P10404 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
P10404 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
P10404 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
P10404 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
P10404 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
P10404 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
P10404 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
P10404 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
P10404 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
P10404 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
P10404 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
P10404 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
P10404 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
P10404 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
P10404 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
P10404 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
P10404 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
P10404 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
P10404 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
P10404 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
P10404 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
P10404 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
P10404 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
P10404 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
P10404 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
P10404 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
P10404 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
P10404 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
P10404 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
P10404 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
P10404 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
P10404 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
P10404 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
P10404 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
P10404 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
P10404 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
P10404 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
P10404 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
P10404 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
P10404 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
P10404 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
P10404 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
P10404 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
P10404 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
P10404 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
P10404 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
P10404 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
P10404 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
P10404 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
P10404 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
P10404 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
P10404 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
P10404 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
P10404 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
P10404 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
P10404 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
P10404 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
P10404 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
P10404 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
P10404 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
P10404 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
P10404 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
P10404 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
P10404 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
P10404 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
P10404 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
P10404 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
P10404 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
P10404 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
P10404 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
P10404 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
P10404 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
P10404 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
P10404 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
P10404 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
P10404 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
P10404 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
P10404 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC13□□□□□ -0.33
P10404 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
P10404 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
P10404 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
P10404 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
P10404 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
P10404 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
P10404 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
P10404 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
P10404 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
P10404 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC13□□□□□ -0.33
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