Protein–RNA interactions for Protein: P0DPB4

Schip1, Schwannomin-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Schip1P0DPB4 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Schip1P0DPB4 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Schip1P0DPB4 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Schip1P0DPB4 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Schip1P0DPB4 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Schip1P0DPB4 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Schip1P0DPB4 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Schip1P0DPB4 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Schip1P0DPB4 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Schip1P0DPB4 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Schip1P0DPB4 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Schip1P0DPB4 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Schip1P0DPB4 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Schip1P0DPB4 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Schip1P0DPB4 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Schip1P0DPB4 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Schip1P0DPB4 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Schip1P0DPB4 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Schip1P0DPB4 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Schip1P0DPB4 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Schip1P0DPB4 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Schip1P0DPB4 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Schip1P0DPB4 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Schip1P0DPB4 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Schip1P0DPB4 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Schip1P0DPB4 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Schip1P0DPB4 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Schip1P0DPB4 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Schip1P0DPB4 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Schip1P0DPB4 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Schip1P0DPB4 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Schip1P0DPB4 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Schip1P0DPB4 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Schip1P0DPB4 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Schip1P0DPB4 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Schip1P0DPB4 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Schip1P0DPB4 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Schip1P0DPB4 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Schip1P0DPB4 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Schip1P0DPB4 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Schip1P0DPB4 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Schip1P0DPB4 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Schip1P0DPB4 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Schip1P0DPB4 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Schip1P0DPB4 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Schip1P0DPB4 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Schip1P0DPB4 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Schip1P0DPB4 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Schip1P0DPB4 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Schip1P0DPB4 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Schip1P0DPB4 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Schip1P0DPB4 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Schip1P0DPB4 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Schip1P0DPB4 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Schip1P0DPB4 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Schip1P0DPB4 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Schip1P0DPB4 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Schip1P0DPB4 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Schip1P0DPB4 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Schip1P0DPB4 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Schip1P0DPB4 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Schip1P0DPB4 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Schip1P0DPB4 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Schip1P0DPB4 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Schip1P0DPB4 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Schip1P0DPB4 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Schip1P0DPB4 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Schip1P0DPB4 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Schip1P0DPB4 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Schip1P0DPB4 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Schip1P0DPB4 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Schip1P0DPB4 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Schip1P0DPB4 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Schip1P0DPB4 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Schip1P0DPB4 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Schip1P0DPB4 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Schip1P0DPB4 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Schip1P0DPB4 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Schip1P0DPB4 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Schip1P0DPB4 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Schip1P0DPB4 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Schip1P0DPB4 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Schip1P0DPB4 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Schip1P0DPB4 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Schip1P0DPB4 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Schip1P0DPB4 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Schip1P0DPB4 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Schip1P0DPB4 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Schip1P0DPB4 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Schip1P0DPB4 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Schip1P0DPB4 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Schip1P0DPB4 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Schip1P0DPB4 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Schip1P0DPB4 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Schip1P0DPB4 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Schip1P0DPB4 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Schip1P0DPB4 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Schip1P0DPB4 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Schip1P0DPB4 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Schip1P0DPB4 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms